GO，KEGG富集分析工具——DAVID

DAVID（https://david.ncifcrf.gov/home.jsp）是一个生物信息数据库，整合了生物学数据和分析工具，为大规模的基因或蛋白列表（成百上千个基因ID或者蛋白ID列表）提供系统综合的生物功能注释信息，帮助用户从中提取生物学信息。

DAVID目前的工具可以实现以下功能

1.识别富集的生物条目，尤其是GO条目

2.发现功能相关的基因集合

3.聚类冗余的注释条目

4.寻找其他功能相关的但是不在列表中的基因

5.列出互作的蛋白质

此外，DAVID还可以进行基因ID的转换

DAVID最常用的功能就是进行基因功能富集分析。富集分析的作用是可以帮助生物学家们了解基因集合的生物学作用。

它的使用方法简单：

STEP1 用户将感兴趣的基因集合粘贴到列表框中或者上传基因结合文件，文件的格式为每行一个基因，或基因间用逗号隔开。

STEP2 选择标识符，从下拉列表中选择上传的基因的标示符，如gene_symbol

STEP3 选择上传基因的类型，是背景基因结合还是要做功能富集的基因结合

STEP4 提交列表，submit list

提交列表后，根据上传基因选择物种，然后点击select species.就得到要分析的结果了。

比如我们想要查看GO的BP条目富集结果，点开后新的页面如下：

点download file可进行下载。