R语言绘图 | 给气泡矩阵图上个色

上次小编教大家用R语言绘制气泡矩阵图后，好多朋友都在后台留言问小编怎么给气泡矩阵图上色，今天小编就教大家怎么给气泡矩阵图上个色 ！

不管我们做什么组学分析，分析到最后总是躲不过富集分析。富集分析我们可以使用R包" clusterProfiler "进行（具体教程见使用clusterProfiler对非模式生物进行富集分析）。

使用Y叔的" clusterProfiler "进行完富集分析后，可以直接使用 dotplot 绘制气泡图，而且配色还十分的好看。

但有时候我们的富集分析结果是用其他工具做出来的，或者想要更改气泡图显示的内容时，又该怎么样做出和Y叔一样的气泡图呢？

如，我想展示结果中A-D四个GO term的富集倍数、q值和count数。

准备输入文件（分为四列，第一列为GO term的描述，第二列为富集倍数，第三列为q值，第四列为count数，以"Tab"为分隔符）：

准备好输入文件后，输入以下代码 ：

## 导入R包
library("ggplot2")
## 导入数据
data <- read.table("input.txt",header = T,sep="\t")
## 绘制气泡图
p <- ggplot(data, aes(x = Enrichment, y = Description, size = Count, color=qvalue)) + geom_point() +xlab("Enrichment Factor")
## 修改气泡颜色
p + scale_color_gradient(low='red',high='blue') +theme_bw()

这样我们就完成气泡图的上色过程啦！

如果想要更改其他颜色，可以在scale_color_gradient 函数中修改。

参考资料：

ggplot2|详解八大基本绘图要素