前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >【Pod Terminating原因追踪系列之二】exec连接未关闭导致的事件阻塞

【Pod Terminating原因追踪系列之二】exec连接未关闭导致的事件阻塞

作者头像
腾讯云原生
修改2020-09-02 14:44:46
2.5K0
修改2020-09-02 14:44:46
举报

岳家瑞,腾讯云后台开发工程师,日常负责K8s生态和运行时相关工作,包括K8s插件开发和运行时问题排查。

前一阵有客户docker18.06.3集群中出现Pod卡在terminating状态的问题,经过排查发现是containerd和dockerd之间事件流阻塞,导致后续事件得不到处理造成的。

定位问题的过程极其艰难,其中不乏大量工具的使用和大量的源码阅读。本文将梳理排查此问题的过程,并总结完整的dockerd和contaienrd之间事件传递流程,一步一步找到问题产生的原因,特写本文记录分享,希望大家在有类似问题发生时,能够迅速定位、解决。

对于本文中提到的问题,在docker19中已经得到解决,但docker18无法直接升级到docker19,因此本文在结尾参考docker19给出了一种简单的解决方案。

删除不掉Pod

相信大家在解决现网问题时,经常会遇到Pod卡在terminating不动的情况,产生这种情况的原因有很多,比如【Pod Terminating原因追踪系列】之 containerd 中被漏掉的 runc 错误信息中提到的containerd没有正确处理错误信息,当然更常见的比如umount失败、dockerd卡死等等。

遇到此类问题时,通常通过kubelet或dockerd日志、容器和Pod状态、堆栈信息等手段来排查问题。本问题也不例外,首先登录到Pod所在节点,使用以下两条指令查看容器状态:

代码语言:txt
复制
#查看容器状态,看到容器状态为updocker ps | grep <container-id>#查看task状态,显示task的状态为STOPPEDdocker-container-ctr --namespace moby --address var/run/docker/containerd/docker-containerd.sock task ls | grep <container-id>

可以看到在dockerd中容器状态为up,但在containerd中task状态为STOPPED,两者信息产生了不一致,也就是说由于某种原因containerd中的状态信息没有同步到dockerd中,为了探究为什么两者状态产生了不一致,首先需要了解从dockerd到containerd的整体调用链:

当启动dockerd时,会通过NewClient方法创建一个client,该client维护一条到containerd的gRPC连接,同时起一个协程processEventStream订阅(subscribe)来自containerd的task事件,当某个容器的状态发生变化产生了事件,containerd会返回事件到client的eventQ队列中,并通过ProcessEvent方法进行处理,processEventStream协程在除优雅退出以外永远不会退出(但在有些情况下还是会退出,在后续会推出一篇文章,恰好是这种情况,敬请期待~)。

当容器进程退出时,containerd会通过上述gRPC连接返回一个exit的task事件给client,client接收到来自containerd的exit事件之后由ProcessEvent调用DeleteTask接口删除对应task,至此完成了一个容器的删除。

由于containerd一直处于STOPPED状态,因此通过上面的调用链猜测会不会是task exit事件因为某种原因而阻塞掉了?产生的结果就是在containerd侧由于发送了exit事件而进入STOPPED状态,但由于没有调用DeleteTask接口,因此本task还存在。

模拟task exit事件

通过发送task exit事件给一个卡住的Pod,来模拟容器结束的情况:

代码语言:txt
复制
/tasks/exit {"container_id":"23bd0b1118238852e9dec069f8a89c80e212c3d039ba030cfd33eb751fdac5a7","id":"23bd0b1118238852e9dec069f8a89c80e212c3d039ba030cfd33eb751fdac5a7","pid":17415,"exit_status":127,"exited_at":"2020-07-17T12:38:01.970418Z"}

我们可以手动将上述事件publish到containerd中,但是需要注意的一点的是,在publish之前需要将上述内容进行一下编码(参考containerd/cmd/containerd-shim/main_unix.go Publish方法)。得到的结果如下图,可以看到事件成功的被publish,也被dockerd捕获到,但容器的状态仍然没有变化。

代码语言:txt
复制
#将file文件中的事件发送到containerddocker-containerd --address var/run/docker/containerd/docker-containerd.sock publish --namespace moby --topic /tasks/exit < ~/file

当我们查看docker堆栈日志(向dockerd进程发送SIGUSR1信号),发现有大量的Goroutine卡在append方法,每次publish新的exit事件都会增加一个append方法的堆栈信息:

通过查看append方法的源码发现,append方法负责将收到的containerd事件放入eventQ,并执行回调函数,对收到的不同类型事件进行处理:

代码语言:txt
复制
func (q *queue) append(id string, f func()) {    q.Lock()    defer q.Unlock()    if q.fns == nil {        q.fns = make(map[string]chan struct{})    }    done := make(chan struct{})    fn, ok := q.fns[id]    q.fns[id] = done    go func() {        if ok {            <-fn        }        f()        close(done)        q.Lock()        if q.fns[id] == done {            delete(q.fns, id)        }        q.Unlock()    }()}

形参中的id为container的id,因此对于同一个container它的事件是串行处理的,只有前一个事件处理结束才会处理下一个事件,且没有超时机制。

因此只要eventQ中有一个事件发生了阻塞,那么在它后面所有的事件都会被阻塞住。这也就解释了为什么每次publish新的对于同一个container的exit事件,都会在堆栈中增加一条append的堆栈信息,因为它们都被之前的一个事件阻塞住了。

深入源码定位问题原因

为了找到阻塞的原因,我们找到阻塞的第一个exit事件append的堆栈信息再详细的看一下:

通过堆栈可以发现代码卡在了docker/daemon/monitor.go文件的123行(省略了不重要的代码):

代码语言:txt
复制
func (daemon *Daemon) ProcessEvent(id string, e libcontainerd.EventType, ei libcontainerd.EventInfo) error {    ......    case libcontainerd.EventExit:        ......        if execConfig := c.ExecCommands.Get(ei.ProcessID); execConfig != nil {            ......123行        execConfig.StreamConfig.Wait()            if err := execConfig.CloseStreams(); err != nil {                logrus.Errorf("failed to cleanup exec %s streams: %s", c.ID, err)            }            ......        } else {            ......        }    ......    return nil}

可以看到收到的事件为exit事件,并在第123行streamConfig在等待一个wg,这里的streamconfig为一个内存队列,负责收集来自containerd的输出返回给客户端,具体是如何处理io的在后面会细讲,这里先顺藤摸瓜查一下wg在什么时候add的:

代码语言:txt
复制
func (c *Config) CopyToPipe(iop *cio.DirectIO) {    copyFunc := func(w io.Writer, r io.ReadCloser) {        c.Add(1)        go func() {            if _, err := pools.Copy(w, r); err != nil {                logrus.Errorf("stream copy error: %v", err)            }            r.Close()            c.Done()        }()    }    if iop.Stdout != nil {        copyFunc(c.Stdout(), iop.Stdout)    }    if iop.Stderr != nil {        copyFunc(c.Stderr(), iop.Stderr)    }    .....}

CopyToPipe是用来将containerd返回的输出copy到streamconfig的方法,可以看到当来自containerd的io流不为空,则会对wg add1,并开启协程进行copy,copy结束后才会done,因此一旦阻塞在copy,则对exit事件的处理会一直等待copy结束。我们再回到docker堆栈中进行查找,发现确实有一个IO wait,并阻塞在polls.Copy函数上:

至此造成dockerd和containerd状态不一致的原因已经找到了!我们来梳理一下。

首先通过查看dockerd和containerd状态,发现两者状态不一致。由于containerd处于STOPPED状态因此判断在containerd发送task exit事件时可能发生阻塞,因此我们构造了task exit事件并publish到containerd,并查看docker堆栈发现有大量阻塞在append的堆栈信息,证实了我们的猜想。

最后我们通过分析代码和堆栈信息,最终定位在ProcessEvent由于pools.Copy的阻塞,也会被阻塞,直到copy结束,而事件又是串行处理的,因此只要有一个事件处理被阻塞,那么后面所有的事件都会被阻塞,最终表现出的现象就是dockerd和containerd状态不一致。

找出罪魁祸首

我们已经知道了阻塞的原因,但是究竟是什么操作阻塞了事件的处理?其实很简单,此exit事件是由exec退出产生的,我们通过查看堆栈信息,发现在堆栈有为数不多的ContainerExecStart方法,说明有exec正在执行,推测是客户行为:

ContainerExecStart方法中第二个参数为exec的id值,因此可以使用gdb查找对应地址内容,查看其参数中的execId和terminating Pod中的容器的exexId(docker inspect可以查看execId,每个exec操作对应一个execId)是否一致,结果发现execId相同!因此可以断定是由于exec退出,产生的exit事件阻塞了ProcessEvent的处理逻辑,通过阅读源码总结出exec的处理逻辑:

那么为什么exec的exit会导致Write阻塞呢?我们需要梳理一下exec的io处理流程看看究竟Write到了哪里。下图为io流的处理过程:

首先在exec开始时会将socket的输出流attach到一个内存队列,并启动了⼀个goroutine用来把内存队列中的内容输出到socket中,除了内存队列外还有一个FIFO队列,通过CopyToPipe开启协程copy到内存队列。FIFO队列用来接收containerd-shim的输出,之后由内存队列写入socket,以response的方式返回给客户端。但我们的问题还没有解决,还是不清楚为什么Write会阻塞住。不过可以通过gdb来定位到Write函数打开的fd,查看一下socket的状态:

代码语言:txt
复制
n, err := syscall.Write(fd.Sysfd, p[nn:max])type FD struct {    // Lock sysfd and serialize access to Read and Write methods.    fdmu fdMutex    // System file descriptor. Immutable until Close.    Sysfd int    ......}

Write为系统调用,其参数中第一位即打开的fd号,但需要注意,Sysfd并非FD结构体的第一个参数,因此需要加上偏移量16字节(fdMutex占16字节)

发现该fd为一个socket连接,使用ss查看一下socket的另一端是谁:

发现该fd为来自kubelet的一个socket连接,且没有被关闭,因此可以判断Write阻塞的原因正是客户端exec退出以后,该socket没有正常的关闭,使Write不断地向socket中写数据,直到写满阻塞造成的。

通过询问客户是否使用过exec,发现客户自己写了一个客户端并通过kubelet exec来访问Pod,与上述排查结果相符,因此反馈客户可以排查下客户端代码,是否正确关闭了exec的socket连接。

修复与反思

其实docker的这个事件处理逻辑设计并不优雅,客户端的行为不应该影响到服务端的处理,更不应该造成服务端的阻塞,因此本打算提交pr修复此问题,发现在docker19中已经修复了此问题,而docker18的集群无法直接升级到docker19,因为docker会持久化数据到硬盘上,而docker19不支持docker18的持久化数据。

虽然不能直接升级到docker19,不过我们可以参考docker19的实现,在docker19中通过添加事件处理超时的逻辑避免事件一直阻塞,在docker18中同样可以添加一个超时的逻辑!

对exit事件添加超时处理:

代码语言:txt
复制
#/docker/daemon/monitor.goctx, cancel := context.WithTimeout(context.Background(), 2*time.Second)execConfig.StreamConfig.WaitWithTimeout(ctx)cancel()
代码语言:txt
复制
#/docker/container/stream/streams.gofunc (c *Config) WaitWithTimeout(ctx context.Context) {    done := make(chan struct{}, 1)    go func() {        c.Wait()        close(done)    }()    select {    case <-done:    case <-ctx.Done():        if c.dio != nil {            c.dio.Cancel()            c.dio.Wait()            c.dio.Close()        }    }}

这里添加了一个2s超时时间,超时则优雅关闭来自containerd的事件流。

至此一个棘手的Pod terminating问题已经解决,后续也将推出小版本修复此问题,虽然修复起来比较简单,但问题分析的过程却无比艰辛,希望本篇文章能够对大家今后的问题定位打开思路,谢谢观看~

本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自微信公众号。
原始发表:2020-08-12,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 腾讯云原生 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
目录
  • 删除不掉Pod
  • 模拟task exit事件
  • 深入源码定位问题原因
  • 找出罪魁祸首
  • 修复与反思
相关产品与服务
容器服务
腾讯云容器服务(Tencent Kubernetes Engine, TKE)基于原生 kubernetes 提供以容器为核心的、高度可扩展的高性能容器管理服务,覆盖 Serverless、边缘计算、分布式云等多种业务部署场景,业内首创单个集群兼容多种计算节点的容器资源管理模式。同时产品作为云原生 Finops 领先布道者,主导开源项目Crane,全面助力客户实现资源优化、成本控制。
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档