【Bioinformatics】文献数据库Pubmed使用方法介绍

Pubmed拥有超过两百四十万的生物医学文献。它们来源于MEDLINE (生物医学文献数据库)、生命科学领域学术杂志以及在线的专业书籍。这些文献大部分提供全文链接。

网站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

下面我们以某基因序列“dUTPase”为例谈谈Pubmed的基本使用方法

1、基本搜索步骤

①搜索框中搜索dUTPase,点击Search

②如下图，你可以改变每个文献显示的内容、排序方式和每页的文献数

③假如一次看不完你想要的文献，你可以把文献保存到本地，步骤如下：勾选你想要的文献，点击Send to ,点击File，最后点击Creat File即可

保存结果如下：

④如果你想搜索某人发表关于dUTPase的文献，你可以这么搜索：【人名 dUTPase】，然后点击你想要的文献

进入文献详情页后，如下图红框处你可以在线阅读或者下载该文献的pdf版本

2、MEDLINE

MEDLINE：数据库中一条文献记录的内部结构信息被分割成小节，每个小节都有自己的索引名，如AU代表作者，AB代表摘要等。

了解了MEDLINE的结构，我们就可以在搜索框按照索引名按照不同规则搜索。举几个栗子：

①按作者名[Au]搜索Down这个词

②按标题[TI]搜索Down这个词

③按实验室地址[AD]搜索Down这个词

④在任何地方搜索Down这个词

3、Pubmed的高级搜索

点击Advanced即可进入图二所示界面进行高级搜索，在高级搜索条件下，你可以通过添加具体条件和运用逻辑符号更加精确的查找你所想要的文献。

4、关于Pubmed使用的几点小建议：

①使用引号(比如，“down syndrome”）引号里的词会被当成一个整体来看待

②使用逻辑词AND OR BUT

比如：dUTPase [Tl] AND bacteria [TI] NOT Smith [AU]

③使用每篇文献唯一的PubMedID，记住这个编号就等于记住这篇文章了(比如，PMID: 24933525)

有时PubMed的也帮不了你:

①搜索1995年以前的文献中排名十位以后的作者是白费力气。

②1976年以前的文献是没有摘要的。

③搜索1965年以前的文献就别想了。