免疫浸润：引文写作分享结束
生信论文的套路
- ONCOMINE从全景、亚型两个维度做表达差异分析；
- 临床标本从蛋白水平确认（或HPA数据库），很重要；
- Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性；
- cBio-portal数据库做基因组学的分析（机制一）；
- STRING互作和GO/KEGG分析探讨可能的信号通路（机制二）；
- TISIDB/TIMER分析肿瘤免疫特征（机制三）。
发表论文是快乐的，因为那是对辛苦付出最好的奖赏。我们对引文写作的介绍和总结到今天就结束了，愿对果友们有帮助。
临床思维源于实战，而科研思维来源于文献阅读。在实验室里跟着师兄师姐甚至导师学习，学到的更多是实验操作。科研思维的学习最好是多读文献。引文是一篇SCI论文的开场白，就象与人见面时的自我介绍一样。因此，引文要简洁清晰，重点突出，有吸引力。
好的引文是论文成功发表的一半。
Introduction包括研究背景的总结和总结、科学问题凝练和提出，是对“故事”来龙去脉的介绍，也决定论文是否被期刊接收。因此，务必重视introduction的写作。
在论文写作时，先选定拟投的期刊，去相应网站阅读期刊的说明（instructions）。不过，期刊说明一般是格式上的要求，如字数限制；内容上要求的比较少。
格式要求请登录拟投稿的期刊官网，内容虽然大多数期刊没有具体要求，但在科研论文中有约定俗成的东西在里面。我们小时候写记叙文——时间、地点、任务和情节，这是基本要素，至于起承转合那是技巧。因此，对于科研论文的基本要素，我们在写作时必须了然于心，这样才能养成良好的写作习惯，写出优秀的生信科研论文。
1 、背景介绍（需要大量阅读和积累，难点）
生信论文的背景介绍有两种通用的方式。
第一种是从疾病入手，即从待研究的肿瘤说起，再介绍该肿瘤的发病率、死亡率、预后和治疗情况，从而提出科学问题，引出待研究的基因；接着介绍基因的基本信息，阐释其功能，归纳式提出该基因在肿瘤中的潜在作用。
第二种是从基因入手，即先介绍基因的基本信息，阐释其功能，在阐释说明该基因在某肿瘤中的作用尚不清楚，从而提出科学问题；接着从待研究的肿瘤说起，介绍该肿瘤的发病率、死亡率、预后和治疗情况，然后解释说该基因可能在该肿瘤中具有重要作用。
整体而言，第二种思路的说服力稍弱，但主要还在写作的效果。
2 、问题归纳（最重要的部分，重点）
背景介绍之后，接下来的部分应该为当前研究提供一个强有力的支撑，也就是凝练、归纳科学问题，提升研究意义，这是引言中最重要的部分。在生信论文写作中，一般是提出某基因可能在一种肿瘤中具有预后价值及其与免疫浸润存在相关性。
问问自己——为什么我的生信论文值得出版？
3 、给出方案（总结式三句话）
引文最后常常是简明扼要地归纳总结，使读者对方法和结论有个整体的认识。基本结构是①介绍通过哪些数据库分析，②获得哪些结果，③最终可以得出什么结论，一目了然。
愿与果友们一起学习，共同成长。
