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从pdb文件中提取蛋白质序列

用户1359560

发布于 2020-09-08 17:18:19

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发布于 2020-09-08 17:18:19

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方法（1）使用pymol的方法 pymol的下载安装使用方法在教程已经叙述过了

提取该蛋白质结构的所有序列 save 1ywt.fasta
仅提取该蛋白质结构的特定chain的序列 save 1ywt.fasta, chain A

方法（2）使用网页在线数据库的方法

https://swift.cmbi.umcn.nl/servers/html/soupir.html

简单两步，就可以得到如下的结果

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