R语言安装ggbiplot

一个有趣的灵魂W

发布于 2020-09-15 15:13:56

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发布于 2020-09-15 15:13:56

ggbiplot画主成分图的案例，让人印象很深，但是用起来好像没那么容易，需要在github上下载安装。但是，ggbiplot在安装的时候经常遇到问题。

按照网上的安装流程：

install.packages("devtools")
library(devtools)
install_github("vqv/ggbiplot")

但是总有许多问题，比如：

library(devtools)
Error in library(devtools) : 不存在叫‘devtools’这个名字的程辑包

如果只是警告还好，不过总是无法安装这个库就让人头疼了。

有人说到github直接下载ggbiplot

尝试之后首先警告，R版本不对，升级R到最新版本后，依然提示不对

install.packages('D:/ggbiplot-master.zip')
Installing package into ‘D:/Anaconda3/Lib/site-packages/rpy2/R/win-library/3.6’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
  package ‘D:/ggbiplot-master.zip’ is not available (for R version 3.6.3)

所以，到底哪出问题了？

最后意外在R的提醒中发现，需要安装

usethis 的包

再次重试：

install.packages('usethis')
library(usethis)
install.packages('devtools')
library(devtools)
install_github("vqv/ggbiplot")
library(ggbiplot)
library(ggplot2)
library(plyr)
library(scales)
library(grid)
library(ggbiplot)
data(wine)
wine.pca <- prcomp(wine, scale. = TRUE)
ggbiplot(wine.pca, obs.scale = 1, var.scale = 1,  groups = wine.class, ellipse = TRUE, circle = TRUE) +
+     scale_color_discrete(name = '') +
+     theme(legend.direction = 'horizontal', legend.position = 'top')

终于正确了：