专栏首页生物信息云PanGPCR | 预测多个潜在的GPCR靶标及其在组织中的表达位置,副作用以及GPCR药物的可能用途

PanGPCR | 预测多个潜在的GPCR靶标及其在组织中的表达位置,副作用以及GPCR药物的可能用途


靶向G蛋白偶联受体(GPCR)(已知的最大治疗靶标)的药物发现具有挑战性。为了促进GPCR药物的快速发现和开发,Yufeng J Tseng等人构建了PanGPCR系统(https://gpcrpanel.cmdm.tw/index.html),以预测多个潜在的GPCR靶标及其在组织中的表达位置,副作用以及GPCR药物的可能用途。使用PanGPCR,将目标化合物对接到包含36个实验确定的晶体结构的文库中,该库包含46个人类GPCR docking 位点,并且从对接中生成了一个排序列表,以评估所有GPCR及其结合亲和力。你可以确定给定化合物的GPCR目标以及相应的潜在用途。此外,通过linking predicted off-targets及其表达的序列标签图谱,可以提供从SIDER数据库收集并映射到45个组织和器官的潜在副作用。使用PanGPCR,只需上传一个小的配体,就可以确定多个靶点,重新定位的潜力和副作用。

只需要提交分子文件,留一个邮箱,就会收到结果。

参考:

Lu-Chi Liu, Ming-Yang Ho, Bo-Han Su, San-Yuan Wang, Ming-Tsung Hsu, Yufeng J Tseng, PanGPCR: Predictions for Multiple Targets, Repurposing and Side Effects, Bioinformatics, , btaa766, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa766

本文分享自微信公众号 - MedBioInfoCloud(MedBioInfoCloud),作者:DoubleHelix

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原始发表时间:2020-09-24

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