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美化cytoscape图片

用户1359560

发布于 2020-10-29 11:12:03

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文章被收录于专栏：生信小驿站

首先我们进入STRING网站的官网(网址为https://string-db.org/)，选择好蛋白的输入方式后，输入一列差异基因，STRING网站对基因的限制条件是不超过2000个基因，格式也是每行一个基因名(蛋白名)。先选择“Multiple protenins”，然后输入基因名，最后选择“Homo sapiens”。

然后点击“SEARCH”选项，继续点击“CONTINUE”选项。

直接点击“Exports”选项，下载TSV格式的文件保存。

导入数据：File-Import -Network-file,然后选择TSV格式的文件。

Layout>Circular layout

我们依次点击Tools- NetworkAnalyzer-Network Analysis-Generate style from statistics。

修改线图宽度为1

最终成图

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