通过总结近期大家在公众号后台的咨询情况,我感觉大家对光密度及其衍生出的两个概念存在不小的混淆——积分光密度、平均光密度。
因此,我觉得有必要单写一篇推文阐述一下这些概念。
▼ 1.为什么会存在概念混淆现象?
问题由来已久。
早期,免疫组化染色的结果判定是通过分级法来做的(现在还在用)。通过肉眼观察,将染色深浅和染色区域大小划定为4个级别,然后再对这些结果进行统计分析。
后来,科研界越来越强调数据的丰富度,加上体视学的发展。大家发现光密度值可以用来反映细胞化学反应的量。
问题就出在这里。由于没有很好地理解光密度概念,导致早期发表的论文(主要是国内期刊)里混淆或错用了相关概念,不同论文中的光密度值甚至能相差数百倍,尽管这些论文中都称自己测量的是“平均光密度”。
如果你延续实验室传统或参考了这些内容,自己也未曾深入探究,最终会导致自己无法判定测量的数据是否正确。
▼ 2.光密度的概念?
现实中,任何彩色的物体对单色光的吸收程度不同,因为会产生不同的吸光度或光密度(OD)。
灰色或黑白图像则是通过0-255灰度值来反映灰度差异。对于切片上的组织或细胞而言,一定的棕色物质(DAB染色)吸收了一定波长的光,从而显示出一定的色彩。OD值越大,说明透光度越低,表示阳性物质的含量越高。
由此,衍生出积分光密度、平均光密度两个重要概念。
▼ 3.积分光密度的概念?
我们在研究时,常常想通过OD值来反映阳性物质的相对含量,这个含量应该是玻片上目标区域内的阳性物质总含量。
载玻片上的组织或细胞被拍摄成图像后,定量分析的目标就变成了图片,而图片是由非常多的像素组成。每个像素OD值都不同,所有这些像素的OD值加在一起,才是我们想要的结果,这个结果就叫积分光密度(IOD)。
还没完。
积分光密度也衍生出一个概念,叫面积积分光密度。它的含义表示组织或细胞的截面内阳性物质的总含量。
这样看来,在论文中我们更应该使用面积积分光密度这个词,最次也得使用积分光密度来表述。
▼ 4.平均光密度的概念?
前面说到,图像是由非常多的像素形成,每个像素的OD值不同。所有像素的OD值之和再除以像素的个数,就叫平均光密度。也就是像素的光密度的算术平均值。
这样一来,平均光密度代表的就是阳性染色区域图像像素的平均OD值,用人话说就是阳性染色物质的颜色深浅。
看到这里,我估计很多人已基本明白了以上概念。
根据这些内容,我再朝前推演一下。实际测量后,积分光密度的数值肯定较大,它代表的是所有OD值的总和;平均光密度的值肯定是较小的,它只是单个像素下的平均OD值。
这些概念在测量时,该如何在软件中去设置和甄别呢?大家点赞或转发支持一下,给我继续更新提供动力吧,哈哈。