前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >关于光密度值,90%的人混淆了这两个概念!

关于光密度值,90%的人混淆了这两个概念!

作者头像
Mark Chen
发布2020-11-02 11:01:47
1.8K0
发布2020-11-02 11:01:47
举报
文章被收录于专栏:聊点学术

通过总结近期大家在公众号后台的咨询情况,我感觉大家对光密度及其衍生出的两个概念存在不小的混淆——积分光密度平均光密度

因此,我觉得有必要单写一篇推文阐述一下这些概念。

▼ 1.为什么会存在概念混淆现象?

问题由来已久。

早期,免疫组化染色的结果判定是通过分级法来做的(现在还在用)。通过肉眼观察,将染色深浅和染色区域大小划定为4个级别,然后再对这些结果进行统计分析。

后来,科研界越来越强调数据的丰富度,加上体视学的发展。大家发现光密度值可以用来反映细胞化学反应的量。

问题就出在这里。由于没有很好地理解光密度概念,导致早期发表的论文(主要是国内期刊)里混淆或错用了相关概念,不同论文中的光密度值甚至能相差数百倍,尽管这些论文中都称自己测量的是“平均光密度”。

如果你延续实验室传统或参考了这些内容,自己也未曾深入探究,最终会导致自己无法判定测量的数据是否正确。

▼ 2.光密度的概念?

现实中,任何彩色的物体对单色光的吸收程度不同,因为会产生不同的吸光度或光密度(OD)。

灰色或黑白图像则是通过0-255灰度值来反映灰度差异。对于切片上的组织或细胞而言,一定的棕色物质(DAB染色)吸收了一定波长的光,从而显示出一定的色彩。OD值越大,说明透光度越低,表示阳性物质的含量越高。

由此,衍生出积分光密度平均光密度两个重要概念。

▼ 3.积分光密度的概念?

我们在研究时,常常想通过OD值来反映阳性物质的相对含量,这个含量应该是玻片上目标区域内的阳性物质总含量。

载玻片上的组织或细胞被拍摄成图像后,定量分析的目标就变成了图片,而图片是由非常多的像素组成。每个像素OD值都不同,所有这些像素的OD值加在一起,才是我们想要的结果,这个结果就叫积分光密度(IOD)

还没完。

积分光密度也衍生出一个概念,叫面积积分光密度。它的含义表示组织或细胞的截面内阳性物质的总含量。

这样看来,在论文中我们更应该使用面积积分光密度这个词,最次也得使用积分光密度来表述。

▼ 4.平均光密度的概念?

前面说到,图像是由非常多的像素形成,每个像素的OD值不同。所有像素的OD值之和再除以像素的个数,就叫平均光密度。也就是像素的光密度的算术平均值。

这样一来,平均光密度代表的就是阳性染色区域图像像素的平均OD值,用人话说就是阳性染色物质的颜色深浅。

看到这里,我估计很多人已基本明白了以上概念。

根据这些内容,我再朝前推演一下。实际测量后,积分光密度的数值肯定较大,它代表的是所有OD值的总和;平均光密度的值肯定是较小的,它只是单个像素下的平均OD值。

这些概念在测量时,该如何在软件中去设置和甄别呢?大家点赞或转发支持一下,给我继续更新提供动力吧,哈哈。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2020-10-12,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 聊点学术 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档