前几天看到一篇综述解读,来源于水生态健康:
里面一个表感觉比较有意思:统计了100多年应用各种统计方法的文章比例。
我自己按照文章所描述的方法也试了一下,Web of Science上,不限语言,文章类型限定Article。时间1900-2020。关键词和原文一致,搜索题目摘要和关键词。得到如下表格,数字为文章数,没有算比例。
我搜索的条件(数据库,文章类型)比原文还严格,但是得到的文章数远远高于他的结果。
原文只到2006年,我搜到了2020,又试了一下Bacteria*和PCA截止到2006,只有406篇,远低于2143,因此可能是这个原因导致的差别。
看来最近十几年是各种统计方法应用井喷的时代。
但是PCA数量/比例最多这一规律是一致的。而其他方法使用比例都很低。我也做了一下CA分析,结果如图。
原文中不同方法能分得比较开,细菌和微生物关键词会聚到一起。而我的结果中不同物种类型分得很开,分析方法则比较集中,离细菌比较近。其中DCA,PCA,CCA,Mantel区分不开。看来不同物种分析方法差距还是比较大的。
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一个环境工程专业却做生信分析的深井冰博士,深受拖延症的困扰。想给自己一点压力,争取能够不定期分享学到的生信小技能,亦或看文献过程中的一些笔记与小收获,记录生活中的杂七杂八。
目前能力有限,尚不能创造知识,只是知识的搬运工。
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