Stegen(基于βNTI和RCbray)的群落构建方法
中提到了Mantel correlogram,试着画了一下。
随便找了个OTU,计算weighted和unweighted Unifrac距离矩阵和环境因子距离矩阵,分别用vegan的mantel.correlog和ecodist的mgram函数画图:
发现weighted和unweighted之间存在差别。而更大的差别出现在不同的函数中。因此用的时候还是需要小心。
且我的结果基本都是不显著的。那么又引出一个问题:显著的系统发育信号在微生物群落中是普遍存在的吗?
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