疾病相关单细胞数据库

对于对于测序而言，单细胞测序算是很火的一个测序技术了。简单来说单细胞测序技术的，就是对每一个细胞来进行测序。相较于之前的RNA-seq而言，我们其实是对某一块组织所有的RNA进行检测，由于一块组织里面有好多的细胞，而且这些细胞也不一定全是肿瘤细胞，所以说我们对于这些细胞的测序获得的基因表达的结果，有可能并不是肿瘤的表达情况。这个时候如果做单细胞测序的话，那就会检测每个细胞当中基因的表达情况了，这样分析的结果就更加精确了。

对于单细胞测序而言，目前已经有很多文章做了其相关的检测，因此也有好多单细胞测序的数据已经公开了，进而也就有很多和单细胞相关的数据库了。今天就给大家介绍一个和疾病相关的单细胞测序数据库sc2disease[http://easybioai.com/sc2disease/home]。相较于其他单细胞的很多分析，这个数据库只要还是用来分析疾病当中的细胞和正常细胞哪些基因有差异的。因此有这个方面需求的可以使用哈。

背景数据集介绍

这个数据库就是收集了目前已经发表的公开的单细胞测序数据。利用相同的流程来分析疾病细胞和正常细胞有没有区别。

由于目前单细胞测序的数据相对来说还是少。所以这个数据库目前还没有做到分析作用疾病或者组织的细胞。目前这个数据库纳入的疾病只有这些。所以有研究这些疾病的童鞋可以尝试使用一下。

数据库使用

相较于其他的数据库，这个数据库的使用更像是对于分析结果的检索功能和下载功能。作者在使用相同的流程分析完目前有的单细胞数据了。最后就可以 获得基因在不同的疾病细胞以及正常细胞当中的表达情况了。相对于于我们而言，就是使用这个数据库来检索这些结果了。

因此这个数据库提供了两个主要的功能

• 浏览：可以一下子观察数据库所有数据的结果
• 检索：可以基于自己想要的基因、疾病以及细胞类型来进行检索

数据下载

除了以上两个功能，数据库还提供了数据下载的功能。利用这个功能我们就可以下载到这个数据库分析的所有结果。这样就方便我们进行自己的自定义搜索了。

数据库使用场景

以上就是这个数据库的主要功能了，首先如果自己研究的疾病在这个数据库里面包含的话，想要更进一步查看肿瘤细胞当中对于某一个基因的表达情况的话，可以使用这个数据库进行查询。