reticulate可以实现R与python的相互切换,即在R里面调用python的脚本、模块等。
library(reticulate)
#查看是否安装python
py_available()
[1] TRUE
当我加载r-velocity这个conda环境时,出现了一个使用python版本的错误
use_condaenv("r-velocity", required = T,conda = "auto")
Error in use_python(python, required = required) : failed to initialize requested version of Python
我查看了一下默认的python路径,是/usr/bin/python下python2.7,但是但是r-velocity环境下是安装的python3.8,且我需要conda路径下面python3.8的版本
Sys.which("python")
## python
## "/usr/bin/python"
尝试了在Rstudio里直接改python路径,似乎并没有效果。
#指定python路径
use_python('/home/miniconda3/bin/python',required = T)
py_config()
经过搜索发现需要改.Renviron文件,这个文件在主目录下,从过ls -a会看到
ls -a
加入conda下的python路径,重新启动RStudio就可以啦
RETICULATE_PYTHON="/home/miniconda3/envs/r-velocity/bin/python"
参考: https://mlog.club/article/4803621 https://www.jianshu.com/p/06dbd8dcc198