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第一个跟着Nature Communications学画图系列合集

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用户7010445
发布2020-11-24 15:26:16
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发布2020-11-24 15:26:16
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第一个 跟着Nature Communications学画图 系列 完结。涉及到的内容包括,基础绘图函数画散点图、基础绘图函数画箱线图、基础绘图函数拼图、ggplot2画散点图分组添加拟合曲线、ggplot2画图拼图、ggplot2画箱线图。

这些内容都来自 Nature Communications 的论文 Fecal pollution can explain antibiotic resistance gene abundances in anthropogenically impacted environments

这篇论文数据分析和可视化的部分用到的数据和代码全部放到了github上 https://github.com/karkman/crassphage_project

非常好的R语言学习素材。

今天将以上内容做一个合集,方便大家查看。

R语言基础绘图函数散点图~跟着Nature Communications学画图~Figure1

跟着Nature Communications学画图~Figure1~ggplot2箱线图

跟着Nature Communications 学画图~ggplot2散点图分组添加拟合曲线

跟着Nature Communications 学画图~ggplot2拼图

跟着Nature Communications 学画图~ggplot2画箱线图

基础绘图函数拼图是一个视频教程

我又找到了一篇Nature Communications 的论文,它用到的代码全都放到了附件里。数据也可以在网上下载。虽然暂时还看不太懂论文的具体研究内容。但是对于我们学习R语言作图来说却是非常好的学习素材。后面的推文会陆续介绍一下这篇论文中的图片的实现代码。下面是论文中的一些截图

image.png

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这篇论文的题目是 Combining gene mutation with gene expression data improves outcome prediction in myelodysplastic syndromes下载链接 https://www.nature.com/articles/ncomms6901 接下来的推文会陆续介绍以上截图中的图片的R语言实现过程。

下载论文和论文的附件大家可以试一下bget这个工具,我也录了一期视频进行介绍。但是我使用的时候遇到的问题是只有Nature Communications的论文附件可以完整下载。其他期刊的都会遇到报错,暂时不知道是什么原因。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2020-11-21,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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