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Diversity and Distributions-估计物种数的几种方法

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Listenlii-生物信息知识分享
发布2021-01-20 10:19:06
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发布2021-01-20 10:19:06
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文章被收录于专栏:Listenlii的生物信息笔记

Journal: Diversity and Distributions

First published: 06 March 2020

Impact factor:3.993

Link:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/ddi.13049

用了多种方法估计了物种数的上限和下限。

本文记录一下。背景和结果部分略。

1.Chao2

2. 稀释曲线估计

3. 种-面积关系

长期以来人们一直在争论,在何种情况下,用幂函数或对数函数。

大多数研究都倾向于幂函数。幂函数和对数模型都可能提供丰富度的上限和下限,但外推到更大的区域的时候对数函数往往低估丰富度。

幂函数模型和对数模型:

4. 物种分布丰度

绝大多数观察到的物种丰度分布都在对数系列(Fisher,1943)和对数正态分布(Preston,1948)所设定的边界内。当应用到一个有限的区域时,两种分布都允许对总丰富度进行评估。

本文采用Ulrich和Ollik(2005)的方法,根据观测到的物种发生分布估算物种丰富度上限(cf. Kunin et al., 2018)。假设观测的物种等级发生分布服从对数序列,则期望丰富度的上限为:

假设SAD服从对数正态分布,物种数下限为:

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原始发表:2021-01-07,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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