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RNA结构分析(2)通过核苷酸序列预测二级结构

(1)RNAfold 服务器

1.输入核苷酸序列 2.点击运行 RNAfold web server http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi

(2)Mfold服务器 www.unafold.org http://www.unafold.org/ 1.设置任务名 2.输入核苷酸序列 3.点击运行fold 4.点击输出页面的vienna,得到‘点括号’形式的二级结构

(3)RNAstructure 服务器 Welcome to the Predict a Secondary Structure Web Server https://rna.urmc.rochester.edu/RNAstructureWeb/Servers/Predict1/Predict1.html

1.设置任务名 2.输入核苷酸序列 3.点击运行

(4)Vfold2D服务器

Vfold2D http://rna.physics.missouri.edu/vfold2D/ 1.设置任务名 2.输入核苷酸序列,输入邮箱 3.点击运行 4.点击模型,生成二级结构‘点括号’

(5)Centroid-Fold服务器 CentroidFold http://rtools.cbrc.jp/centroidfold/ 1.输入核苷酸序列 2.点击运行 3.计算结束后点击txt,即可得到‘点括号’形式的二级结构

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