欢迎关注密西根大学张阳实验室开发的I-TASSER蛋白质结构和功能预测服务器!
CASP(www.predictioncenter.org)每两年举行一次,迄今已经举办13届。该比赛旨在吸引计算机科学、生物物理学等不同领域的专家参与到蛋白质三维结构预测这一极具挑战性的生物信息学问题中来,共同评估发展现状和讨论未来的趋势。被誉为蛋白质结构预测领域“奥林匹克”比赛。
I-TASSER(亦称Zhang Server)连续7次在CASP7、CASP8、CASP9、CASP10、CASP11、CASP12和CASP13竞赛Server组中排名第一。该服务器一直在持续开发,其目标是使用最先进的算法提供最为准确的蛋白质结构和功能预测。
蛋白质分子的结构和功能的测定是现代生物学和医学的基石。张阳实验室的主要研究方向之一为蛋白质结构预测,即开发从氨基酸序列预测蛋白质分子三维结构的计算方法,并根据从序列到结构再到功能的范式推导蛋白质分子的生物学功能。实验室的第二个研究重点是将计算算法和生物化学实验结合起来,设计出新的蛋白质分子,它们的功能将比比天然蛋白质更强。此外,实验室也致力于建立配体-蛋白和蛋白-蛋白相互作用的模型,尤其是专注于筛选针对人类基因组中G蛋白偶联受体的新药研发。
实验室也提供QUARK、LOMETS、COACH、DEMO、TM-score、TM-align、SPICKER、PSSpred、ResPRE以及DeepMSA等预测工具和在线服务器(网址:https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/),欢迎各位研究人员使用。
最近,张阳实验室利用I-TASSER服务器,对武汉肺炎冠状病毒2019-nCov基因组10个开放阅读框架24个成熟蛋白进行结构预测,并利用实验室开发的DEMO算法完成多结构域组装。并将预测得到的所有蛋白质全长结构公布于https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/C-I-TASSER/2019-nCov/,欢迎有需要的科研团队使用,后续的功能和蛋白质相互作用也将于近期公布。