前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >详解PyTorch编译并调用自定义CUDA算子的三种方式

详解PyTorch编译并调用自定义CUDA算子的三种方式

作者头像
godweiyang
发布2021-04-08 11:05:49
2.3K0
发布2021-04-08 11:05:49
举报
文章被收录于专栏:算法码上来算法码上来

「上一篇教程:」 https://godweiyang.com/2021/03/18/torch-cpp-cuda

本篇教程我们主要讲解如何「编译并调用」之前我们写好的CUDA算子,完整的代码还是放在了github仓库,欢迎大家star并fork:https://github.com/godweiyang/torch-cuda-example

我保证,这是你网上简单「最为精简、最容易看懂」的一套代码了,因为我自己也是刚入门,复杂的我也看得累。

运行环境

  • NVIDIA Driver: 418.116.00
  • CUDA: 11.0
  • Python: 3.7.3
  • PyTorch: 1.7.0+cu110
  • CMake: 3.16.3
  • Ninja: 1.10.0
  • GCC: 8.3.0

这是我自己的运行环境,显卡是V100,其他环境不保证可以运行,但是大概率没问题,可能要做轻微修改。

代码结构

代码语言:javascript
复制
├── include
│   └── add2.h # cuda算子的头文件
├── kernel
│   ├── add2_kernel.cu # cuda算子的具体实现
│   └── add2.cpp # cuda算子的cpp torch封装
├── CMakeLists.txt
├── LICENSE
├── README.md
├── setup.py
├── time.py # 比较cuda算子和torch实现的时间差异
└── train.py # 使用cuda算子来训练模型

代码结构还是很清晰的。include文件夹用来放cuda算子的头文件(.h文件),里面是cuda算子的定义。kernel文件夹放cuda算子的具体实现(.cu文件)和cpp torch的接口封装(.cpp文件)。

最后是python端调用,我实现了两个功能。一是比较运行时间,上一篇教程详细讲过了;二是训练一个PyTorch模型,这个下一篇教程再来详细讲述。

编译cpp和cuda文件

JIT

JIT就是just-in-time,也就是即时编译,或者说动态编译,就是说在python代码运行的时候再去编译cpp和cuda文件。

JIT编译的方法上一篇教程已经演示过了,只需要在python端添加load代码即可:

代码语言:javascript
复制
import torch
from torch.utils.cpp_extension import load
cuda_module = load(name="add2",
                   extra_include_paths=["include"],
                   sources=["kernel/add2.cpp", "kernel/add2_kernel.cu"],
                   verbose=True)
cuda_module.torch_launch_add2(c, a, b, n)

需要注意的就是两个参数,extra_include_paths表示包含的头文件目录,sources表示需要编译的代码,一般就是.cpp.cu文件。

cpp端用的是pybind11进行封装:

代码语言:javascript
复制
PYBIND11_MODULE(TORCH_EXTENSION_NAME, m) {
    m.def("torch_launch_add2",
          &torch_launch_add2,
          "add2 kernel warpper");
}

JIT编译看起来非常的简单,运行过程中也基本没有碰到坑,非常顺利。

运行成功的话可以看到Ninja调用了三条命令来编译:

代码语言:javascript
复制
[1/2] nvcc -c add2_kernel.cu -o add2_kernel.cuda.o
[2/3] c++ -c add2.cpp -o add2.o
[3/3] c++ add2.o add2_kernel.cuda.o -shared -o add2.so

由于输出太长,我省略了多数的参数信息,并精简了指令。可以看出先是调用nvcc编译了.cu,生成了add2_kernel.cuda.o;然后调用c++编译add2.cpp,生成了add2.o;最后调用c++生成动态链接库add2.so

Setuptools

第二种编译的方式是通过Setuptools,也就是编写setup.py,具体代码如下:

代码语言:javascript
复制
from setuptools import setup
from torch.utils.cpp_extension import BuildExtension, CUDAExtension

setup(
    name="add2",
    include_dirs=["include"],
    ext_modules=[
        CUDAExtension(
            "add2",
            ["kernel/add2.cpp", "kernel/add2_kernel.cu"],
        )
    ],
    cmdclass={
        "build_ext": BuildExtension
    }
)

编写方法也非常的常规,调用的是CUDAExtension。需要在include_dirs里加上头文件目录,不然会找不到头文件。

cpp端用的是pybind11进行封装:

代码语言:javascript
复制
PYBIND11_MODULE(TORCH_EXTENSION_NAME, m) {
    m.def("torch_launch_add2",
          &torch_launch_add2,
          "add2 kernel warpper");
}

接着执行:

代码语言:javascript
复制
python3 setup.py install

这样就能生成动态链接库,同时将add2添加为python的模块了,可以直接import add2来调用。

如果执行正常的话,也是可以看到两条编译命令的:

代码语言:javascript
复制
[1/2] nvcc -c add2_kernel.cu -o add2_kernel.o
[2/2] c++ -c add2.cpp -o add2.o

然后会执行第三条:

代码语言:javascript
复制
x86_64-linux-gnu-g++ -shared add2.o add2_kernel.o -o add2.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so

最后同样生成了一个动态链接库,不过python端我们不需要加载这个动态链接库,因为setuptools已经帮我们把cuda算子调用的接口注册到python模块里了,直接import即可:

代码语言:javascript
复制
import torch
import add2
add2.torch_launch_add2(c, a, b, n)

需要注意的是,这里我踩了一个坑,.cpp.cu文件名不要相同,也最好不要取容易与python自带库重复的名字」。此外要先import torch,然后再import add2,不然也会报错。

CMake

最后就是cmake编译的方式了,要编写一个CMakeLists.txt文件,代码如下:

代码语言:javascript
复制
cmake_minimum_required(VERSION 3.1 FATAL_ERROR)
# 修改为你自己的nvcc路径,或者删掉这行,如果能运行的话。
set(CMAKE_CUDA_COMPILER "/usr/local/cuda/bin/nvcc")
project(add2 LANGUAGES CXX CUDA)

find_package(Torch REQUIRED)
find_package(CUDA REQUIRED)
find_library(TORCH_PYTHON_LIBRARY torch_python PATHS "${TORCH_INSTALL_PREFIX}/lib")

# 修改为你自己的python路径,或者删掉这行,如果能运行的话。
include_directories(/usr/include/python3.7)
include_directories(include)

set(SRCS kernel/add2.cpp kernel/add2_kernel.cu)
add_library(add2 SHARED ${SRCS})

target_link_libraries(add2 "${TORCH_LIBRARIES}" "${TORCH_PYTHON_LIBRARY}")

这里踩了好几个大坑。首先是找不到nvcc的路径,于是第3行先设置了一下,当然如果你删了也能跑那就更好。然后是找不到python的几个头文件,于是加上了第11行,同样如果你删了也能跑那就更好。最后是一个巨坑,没有链接TORCH_PYTHON_LIBRARY,导致动态链接库生成成功了,但是调用执行一直报错,所以加上了第8行和第17行。

cpp端用的是TORCH_LIBRARY进行封装:

代码语言:javascript
复制
TORCH_LIBRARY(add2, m) {
    m.def("torch_launch_add2", torch_launch_add2);
}

这里不再使用pybind11,因为我的pybind11没有使用conda安装,会出现一些编译问题,详见:https://github.com/pybind/pybind11/issues/1379#issuecomment-489815562。

编写完后执行下面编译命令:

代码语言:javascript
复制
mkdir build
cd build
cmake -DCMAKE_PREFIX_PATH="$(python3 -c 'import torch.utils; print(torch.utils.cmake_prefix_path)')" ../
make

最后会在build目录下生成一个libadd2.so,通过如下方式在python端调用:

代码语言:javascript
复制
import torch
torch.ops.load_library("build/libadd2.so")
torch.ops.add2.torch_launch_add2(c, a, b, n)

如果编译成功的话,可以看到如下输出信息:

代码语言:javascript
复制
Building CXX object CMakeFiles/add2.dir/kernel/add2.cpp.o
[ 66%] Building CUDA object CMakeFiles/add2.dir/kernel/add2_kernel.cu.o
[100%] Linking CXX shared library libadd2.so
[100%] Built target add2

执行python

这里我实现了两个功能,代码都很简单,一个是测试时间,一个是训练模型。都可以通过参数--compiler来指定编译方式,可供选择的就是上面提到的三种:jit、setup和cmake。

比较运行时间

代码语言:javascript
复制
python3 time.py --compiler jit
python3 time.py --compiler setup
python3 time.py --compiler cmake

训练模型

代码语言:javascript
复制
python3 train.py --compiler jit
python3 train.py --compiler setup
python3 train.py --compiler cmake

总结

至此三种编译cuda算子并python调用的方式基本都囊括了,下一篇教程将讲讲PyTorch如何将自定义cuda算子加入到计算图中,并实现前向和反向传播,最终训练模型。

- END -

我是godweiyang,华东师范大学计算机系本硕专业第一,字节跳动AI Lab NLP算法工程师,秋招斩获上海三家互联网大厂ssp offer,主要研究方向为机器翻译、句法分析、模型压缩与加速。最大特点就是脾气好、有耐心,有任何问题都可以随时咨询我,不管是技术上的还是生活上的。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划,分享自微信公众号。
原始发表:2021-03-21,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 算法码上来 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体分享计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
目录
  • 运行环境
  • 代码结构
  • 编译cpp和cuda文件
    • JIT
      • Setuptools
        • CMake
        • 执行python
          • 比较运行时间
            • 训练模型
            • 总结
            相关产品与服务
            机器翻译
            机器翻译(Tencent Machine Translation,TMT)结合了神经机器翻译和统计机器翻译的优点,从大规模双语语料库自动学习翻译知识,实现从源语言文本到目标语言文本的自动翻译,目前可支持十余种语言的互译。
            领券
            问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档