A Bioinformatics Pipeline to Accurately and Efficiently Analyze the MicroRNA Transcriptomes in Plants
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这个地方标注是 video Article 是怎么回事呢?
我到文章中提到的URL去看了看,发现,论文是对应着有视频介绍的
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但是注册了以后好像也只有12小时的试用时间,不知道是不是试用时间结束后需要收费
这个 jove journal of visualized experiments 大家有了解的吗?
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应该抽时间仔细看看这个网页
不看视频也可以论文中描述的也很详细了
第二篇论文是
miRDeep-P2: accurate and fast analysis of the microRNA transcriptome in plants
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对应的是软件发表的论文
软甲的下载链接
miRDP2 - Browse /latest_version at SourceForge.net
分别有
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软件依赖 bowtie2 和 RNAfold 这两个软件 直接使用conda就可以安装,RNAfold对应的软件是 viennarna
开头提到的论文里的第六步已经走不通了
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需要换成软件手册里的命令
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还遇到一个问题是小RNA的测序数据应该如何准备成为软件的输入数据呢?
这一步做好以后接下来应该做什么分析呢?暂时还搞不明白,需要再看论文
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