跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2一次性画好多个饼状图
跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2一次性画好多个饼状图
用户7010445
发布于 2021-05-07 10:55:23
发布于 2021-05-07 10:55:23
文章被收录于专栏：小明的数据分析笔记本
今天推文重复的图来自于 论文 Whole-genome resequencing of 445 Lactuca accessions reveals the domestication history of cultivated lettuce
image.png
今天试着重复的图片对应着的是论文附件中的Figure8b，很多个饼状图放到一起
image.png
最基本的想法就是单独画好多个饼状图，然后通过拼图实现，但是因为之前重复地图的时候新遇到了一个包是 scattermore可以直接指定输入数据，然后一次性将所有饼状图画好，这样就省去了拼图的步骤
通过 help(package="scatterpie")函数查看帮助文档，得知需要准备的数据格式如下
image.png
x,y指定饼状图的位置坐标，接下来就紧跟饼状图每个部分的数据 ，那接下来就模仿这个数据
模仿数据的代码
x<-rep(seq(2,14,2),4)
y<-as.numeric(as.character(gl(4,7,labels = c(2,4,6,8))))
A<-sample(1:100,28)
B<-100-A
df<-data.frame(x=x,
y=y,
A=A,
B=B,
region=as.character(1:28))
df
str(df)
head(df)
画图代码
library(scatterpie)
library(ggplot2)
ggplot()+
geom_scatterpie(data=df,
aes(x,y,group=region,r=0.9),
cols = c("A","B"))+
coord_equal()+
theme_void()+
theme(legend.position = "none")+
scale_fill_manual(values = c("#5b9bd5","#e64b35"))
结果如下
image.png
接下来是添加头部的图例和右侧的文字
首先是构造数据的代码
df1<-data.frame(
x=seq(1.9,14,2),
y=9.5,
label=c("A","A","C","C","C","A","T")
)
df2<-data.frame(
x=seq(2.1,15,2),
y=9.5,
label=c("A","A","C","C","C","A","T")
)
df3<-data.frame(
x=16,
y=c(2,4,6,8),
label=c("AAAAA","BBBBBB","CCCCCCC","DDDDDD")
)
画图代码
ggplot()+
geom_scatterpie(data=df,
aes(x,y,group=region,r=0.9),
cols = c("A","B"))+
coord_equal()+
theme_void()+
theme(legend.position = "none")+
scale_fill_manual(values = c("#5b9bd5","#e64b35"))+
geom_label(data=df1,aes(x=x-0.1,y=y,label=label),
fill="#5b9bd5")+
geom_label(data=df2,aes(x=x+0.1,y=y,label=label),
fill="#e64b35")+
geom_text(data=df3,aes(x=x,y=y,label=label))
image.png
模仿的还差不多
这里遇到一个问题是：ggplot2添加文本的时候默认是以坐标轴的位置居中分布的，有没有办法让文本以坐标的位置居左或者居右来呢？暂时还不知道如何设置
欢迎大家关注我的公众号
小明的数据分析笔记本
小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记！
本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划，分享自微信公众号。
原始发表：2021-05-04，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
评论
登录后参与评论
推荐阅读
目录
腾讯云开发者
