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手把手教你用Graphpad Prism绘制基因结构示意图

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百味科研芝士
发布2021-06-08 18:31:22
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发布2021-06-08 18:31:22
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文章被收录于专栏:百味科研芝士百味科研芝士

话说基因结构示意图,张老湿这里不应该是用PPT画么?

当然,都可以,反正都是奇奇怪怪的不正经应用。Graphpad Prism当然可以跟PPT一样,通过插入几个矩形拼接出基因结构,但矩形大小没法真实对应基因元件的长度,那还不如用PPT画呢。

既然使用Graphpad Prism绘制,那么就要准确分区核苷酸序列,顺路还可以学习Graphpad Prism的一些小技巧,其绘制结果如下图所示。

1、打开软件,新建一个Grouped(行列分组表)或者Contingency(列联表);

2、按照下图输入某基因结构分区数据,各数据表示核苷酸坐标;

3、选择Summary data下的水平Stacked bars(堆积柱状图);

4、双击绘图区或者单击工具栏Format Graph图标,进入Format Graph,在Appearance选项卡中,选择Global-Change all data sets,然后取消勾选Show legend,把所有图例隐藏;

  • 在Data Sets on Graph选项卡中,选中B~F列数据,将其和A列数据的关系都改为Superimposed(叠印),绘制叠印柱状图。此时,图中各矩形所占空间变短,自动生成的坐标轴范围不再适用,后面需要调整X轴范围。
  • 注意:Graphpad Prism中不能直接绘制叠印柱状图,需要以上述方式曲线绘制。

5、双击坐标轴或者单击工具栏Format Axes图标进入坐标轴设置界面。将图形Shape改为Custom(自定义)的22cm×2cm,Frame style选择为No Frame、隐藏X和Y轴(Show Scale Bar也要取消勾选)。

  • 将X轴范围最大值改为核苷酸刻度的最大值,这里是1453。

6、删掉图标题和X、Y轴标题,使用文本框工具添加文本,适用箭头工具添加标记。

  • 如果觉得默认配色不好看,可以自定义每一段的颜色

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原始发表:2021-05-27,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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