专栏首页生信补给站精心整理(含图PLUS版)|R语言生信分析,可视化

精心整理(含图PLUS版)|R语言生信分析,可视化

为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理(PLUS)。建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢!

R资料+计划

R语言精品资料年中无套路赠送

R-plotly|交互式甘特图(Gantt chart)-项目管理/学习计划

Bioinfo

R|fastqcr QC数据处理 :测序结果的数据质控及图标展示;

Bioinfo|bedtools-操作VCF文件 VCF文件的常见合并,过滤等操作;

R|生存分析(1) :生存分析介绍以及R实现,KM绘图;

R|生存分析 - KM曲线 ,必须拥有姓名和颜值

R|生存分析-结果整理 :一键式输出所有变量的COX结果;

R|timeROC-分析 :时间依赖的生存分析;

Nomogram(诺莫图) | Logistic、Cox生存分析结果可视化

Forest plot(森林图) | Cox生存分析可视化

R-forestplot包| HR结果绘制森林图

maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化

maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图)

R|tableone 快速绘制文章“表一”-基线特征三线表

ggballoonplot|气球图-多分类数据可视化

ggrisk|高效绘制风险因子联动图

ggalluvial|炫酷桑基图(Sankey),你也可以秀

R|散点图+边际图(柱形图,小提琴图),颜值区UP

UpSet|多集合可视化,韦恩图?upSet!

pheatmap|暴雨暂歇,“热图”来袭!!!

ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来

R|clusterProfiler-富集分析

ggplot2| 绘制KEGG气泡图

ggplot2|绘制GO富集柱形图

ggplot2|从0开始绘制PCA图

ggplot2|玩转Manhattan图-你有被要求这么画吗?

Bio|manhattan图

TCGA + GEO

TCGA|根据somatic mutation绘制突变景观图(oncoplot)和基因词

TCGA数据挖掘 | Xena - TCGA数据下载

TCGA | 以项目方式管理代码数据 以及 数据读取存储

差异分析|DESeq2完成配对样本的差异分析

barplot3d|圣诞节送你一个mutation signature搭建的“乐高”

deconstructSigs|探寻cosmic的独特“气质”-mutation signature !

base + ggplot2

R|绘图边距及布局

R-基本绘图参数(Ⅰ)

ggplot2|详解八大基本绘图要素

ggplot2|theme主题设置,详解绘图优化-“精雕细琢”

ggplot2 |legend参数设置,图形精雕细琢

ggplot2-annotation|画图点“精”,让图自己“解释”

R-ggpmisc|回归曲线添加回归方程,R2,方差表,香不香?

ggforce|绘制区域轮廓-区域放大-寻找你的“onepiece”

ggplot2|从0开始绘制直方图

ggplot2|从0开始绘制折线图

ggplot2|从0开始绘制箱线图

绘图系列|R-corrplot相关图

绘图系列|R-wordcloud2包绘制词云

绘图系列|R-VennDiagram包绘制韦恩图

ggplot2|发散性“正负”图

R|UpSet-集合可视化

ggplot2|ggpubr进行“paper”组图合并

ggplot2|扩展包从0开始绘制雷达图

R|plotly

ggstatsplot绘图|统计+可视化,学术科研神器

2-14 |“特殊”的日子,多学一种表达爱的方式

本文分享自微信公众号 - 生信补给站(Bioinfo_R_Python),作者:生信补给站

原文出处及转载信息见文内详细说明,如有侵权,请联系 yunjia_community@tencent.com 删除。

原始发表时间:2021-06-16

本文参与腾讯云自媒体分享计划,欢迎正在阅读的你也加入,一起分享。

我来说两句

0 条评论
登录 后参与评论

相关文章

  • 强大的图形功能软件:S-Plus

    【摘要】S语言是由AT&T 贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析、作图的解释型语言。它的丰富的数据类型(向量、数组、列表、对象等)特别有利于实现新的统...

    CDA数据分析师
  • 告诉你做数据分析必须学R的4个理由

    论坛君:你很可能已经听说过 R,或许你知道 R 是一种编程语言,而且知道它与统计学有关,但它是否适合您呢?本文作者将试图向大家讲解他对R的看法,分享他认为试用开...

    小莹莹
  • 生信人的R语言视频教程-语法篇-第一章:与R的第一次相亲

    R:为什么选择我?而不是其他高级语言,比如Python,Java,C,C++....那么多编程语言?

    DoubleHelix
  • 做数据分析必须学R的4个理由

    R 是一种灵活的编程语言,专为促进探索性数据分析、经典统计学测试和高级图形学而设计。R 拥有丰富的、仍在不断扩大的数据包库,处于统计学、数据分析和数据挖掘发展的...

    小莹莹
  • 做数据分析必须学R的4个理由

    R 是一种灵活的编程语言,专为促进探索性数据分析、经典统计学测试和高级图形学而设计。R 拥有丰富的、仍在不断扩大的数据包库,处于统计学、数据分析和数据挖掘发展的...

    华章科技
  • 做数据分析必须学R语言的4个理由

    R 是一种灵活的编程语言,专为促进探索性数据分析、经典统计学测试和高级图形学而设计。R 拥有丰富的、仍在不断扩大的数据包库,处于统计学、数据分析和数据挖掘发展的...

    小莹莹
  • R语言基础教程——第1章:初识R

    R是统计领域广泛使用的诞生于1980年左右的S语言的一个分支。可以认为R是S语言的一种实现。而S语言是由AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析和...

    DoubleHelix
  • 数据挖掘工具R软件与Weka的比较分析

    作为数据挖掘常用的两个工具软件,R软件和weka软件各有千秋,本文对这两种数据挖掘软件进行了比较与分析。 R软件介绍 R是统计领域广泛使用的一款软件,...

    机器学习AI算法工程
  • R语言学习由浅入深路线

    现在对R感兴趣的人越来越多,很多人都想快速的掌握R语言,然而,由于目前大部分高校都没有开设R语言课程,这就导致很多人不知道如何着手学习R语言。 对于初学R语言的...

    小莹莹
  • R语言学习由浅入深路线图

    对于初学R语言的人,最常见的方式是:遇到不会的地方,就跑到论坛上吼一嗓子,然后欣然or悲伤的离去,一直到遇到下一个问题再回来。当然,这不是最好的学习方式,最好的...

    CDA数据分析师
  • 【学习】Think SAS(一)

    为什么你应该学Sas?本文不想卷入SAS与R,或者与SPSS、S-Plus、Matlab等统计软件孰优孰劣的争论中去,我是说,作为一个有志于投身工...

    小莹莹
  • R语言学习路线和常用数据挖掘包

    对于初学R语言的人,最常见的方式是:遇到不会的地方,就跑到QQ群、论坛上吼一嗓子,然后欣然or悲伤的离去,一直到遇到下一个问题再回来。当然,这不是最好的学习方...

    机器学习AI算法工程
  • R语言学习路线和常用数据挖掘包

    对于初学R语言的人,最常见的方式是:遇到不会的地方,就跑到论坛上吼一嗓子,然后欣然or悲伤的离去,一直到遇到下一个问题再回来。当然,这不是最好的学习...

    机器学习AI算法工程
  • R语言学习路线和常用数据挖掘包

    对于初学R语言的人,最常见的方式是:遇到不会的地方,就跑到论坛上吼一嗓子,然后欣然or悲伤的离去,一直到遇到下一个问题再回来。当然,这不是最好的学习方式...

    机器学习AI算法工程
  • 【干货】1000位产品经理推荐的数据分析书籍

    世界如此喧嚣,知识何其稀少。这是一个信息爆炸的时代,被资讯洪流裹挟的我们,都养成了非常不好的思维习惯:把信息当作知识,把收藏当作学习,把阅读当作思考,把储存当作...

    钱塘数据
  • C加加初学者需要看什么书

    计算机基础的话下一步,没有就看《深入理解计算机系统》; ? 分享之前我还是要推荐下我自己的C/C++学习交流裙:三 四 三 八 九 一 三 六 五,不管你是小白...

    企鹅号小编
  • SQLite虚拟机

    1 前言 本文主要介绍SQLite虚拟机VDBE,为了更好地了解SQLite虚拟机,文中也加入了一些Lua虚拟机内容来对比学习,更好地了解不同虚拟机之间的异同...

    微信终端开发团队
  • R与数据分析学习总结之一:R语言基本操作

    ? 最近开始学习R语言,把学习笔记和小伙伴们分享一下吧,欢迎一起交流 R 起源: R是S语言的一种实现。S语言是由 AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探...

    小莹莹
  • 微生物组—宏基因组分析专题研讨会(2020.2)

    在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《宏基因组》在2020年2月14-16日,北京鼓楼推出《宏基因组分析》专题培训第七期,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同...

    生信宝典

扫码关注云+社区

领取腾讯云代金券