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实名举报同门师兄博士论文数据造假,导致其同门师弟无法顺利完成实验!

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百味科研芝士
发布2021-07-12 15:31:43
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发布2021-07-12 15:31:43
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文章被收录于专栏:百味科研芝士百味科研芝士
来源 | 知乎专栏:https://zhuanlan.zhihu.com/p/371018409

近日,网曝复旦大学某吕姓博士论文数据造假,同门师弟无法重复数据。本文仅限转载,而且此事已过去10年之久,为何此时曝出,尚有疑问,具体调查结果以官方为准。

我是在2010年10月正式进入赵**在上海植生所的实验室进行博士后研究。我没有想到的是这段博后时光却成为我科研人生的一段噩梦。我进站之后做的第一个课题是顺着赵**在复旦大学招收的博士生吕**在博士期间发表的文章往下做。该文章刊登在JBC (2010) 285: 28076-28085。

图 1 吕**JBC文章的题目及相关图(原文中的图4)

我的课题计划是研究在M. smegmatis菌中mazG基因在氧化压力下受同一操纵子基因tetR转录调控的分子机制,目的是想看mazG的表达在H2O2氧化条件下是否受到TetR的调控。然而,从2010年的9月份一直到2011年的3月份,我一直无法重复出吕**JBC文章中图4的实验结果(图1),也就是说,我没有看到mazGrelA在H2O2刺激下表达增加。随后,吕**自己重复了3次也没有重复出他的结果(其中两次是我跟随他一起做的)。随后我决定采用在H2O2刺激下高表达的基因katGfurA作为阳性对照来继续验证他的实验,我发现在我能够重复出katGfurA在氧化条件下(5mM或10mM H2O2)高表达的同时,mazGrelA依然没有出现高表达(图2A)。我把我的实验结果发给赵**及实验室其他人之后,大家立刻明白是怎么回事了,但赵**只是终止了这个项目,没有撤稿,也没有公开承认吕**伪造实验数据。实验室大小负责人多次暗示或明确表示我(们)不要把这个事情张扬出去。赵**在2011年9月份给我的邮件中明确暗示了吕**的文章有问题。

图 2 (A)我在2011年的RT-PCR实验结果,结果显示katGfurA在H2O2诱导下高表达,而mazGrelA并没有出现高表达,反而是一定程度的降低表达。(B)我从PLoS ONE 10(7): e0134596附加材料中得到的实验数据做出来的直方图,同样显示mazGrelA在H2O2诱导下表达是降低,而不是增高的。

从2010年9月-2011年9月,我重复了大约40次左右实验,作者本人吕**重复了3次,都没有一次能够重复出JBC文章中的结果。每次重复我都是从培养M. smegmatis开始,H2O2诱导,抽提RNA,做反转录,然后做RT-PCR或者荧光定量PCR,一轮下来,差不多快一周时间,每次抽提RNA都会用到很多有一定毒性的试剂:苯酚和氯仿,我真的抽得快要吐血了。另外,吕**在他自己进行重复他的实验结果之前(也就是我要跟随他一起去上海市公共卫生中心做这些实验之前)的某一天,突然他打电话给我,大意是说我这样做对他不好,学校知道了会怎样怎样的。当时我只是觉得他说的话很蹊跷,并没有多想。在整个过程中,吕**拒绝给我看他的博士论文和任何实验记录。该项目之后,我在赵**实验室做的第二个项目在已经做了很长时间并有部分实验结果的情况下突然无缘无故被终止,其目的就是让我在科研上起不来,从而也就不敢向外界公开此事。而吕**在两轮博士后结束之后,以一篇并列第一作者(排第2位置)的PLoS ONE (2008),一篇数据造假的JBC和一篇并列第一作者的PLoS Pathogens (2013),于2015年9月在赵**的安排下进入复旦大学医学院任副教授至今。

图3 (A)mazG所在操纵子示意图,在氧化条件下,TetR结合在自己的启动子上抑制mazG-mfd-tetR的表达(FEBS Letters文章已证实)。(B)我从PLoS ONE 10(7): e0134596附加材料中得到的实验数据做出来的直方图,进一步说明了在氧化条件下mazG-mfd-tetR是低表达的。(C)是FEBS Letters 594(17): 2867-2880文章通过实验说明了虽然mazG在氧化条件下对M. smegmatis具有一定的保护作用,但同时也说明了在氧化条件下,mazG的表达是受TetR (Rv1019)抑制的。

幸运的是,该事情过去近10年间,我查阅到有两篇文章直接支持了我的结果,进一步说明了吕**在JBC文章中数据造假。这些文章也让我有更多的勇气来向大众陈述揭发此事。在2015年,中科院微生物所课题组发表在PLoS ONE 10(7): e0134596上的文章“Distinct Responses of Mycobacterium smegmatis to Exposure to Low and High Levels of Hydrogen Peroxide”进一步提供了直接的证据。作者采用转录组学的方法研究在低浓度(0.2 mM)和高浓度(7 mM)H2O2诱导条件下M. smegmatis体内基因转录情况。该研究结果显示,在7 mM H2O2诱导条件下,katGfurA高表达,而mazGrelA并没有出现高表达(图2B)。这个实验结果进一步支持我的实验结果,同时也说明了吕**JBC文章图4的结论完全是伪造的。

2020年,FEBS Letters 594(17): 2867-2880上发表了“Mycobacterium tuberculosis TetR family transcriptional regulator Rv1019 is a negative regulator of the mfd-mazG operon encoding DNA repair proteins.” 这篇文章主要内容其实就是我原本在2010年博士后阶段要做的那个课题,终于该课题在2020年被印度的一个实验室完成了。在该论文中,作者发现在M. smegmatis体内,TetR结合到它自己的启动子上,负调控tetR-mfd-mazG操纵子表达(图3A)。并且,作者还发现虽然mazG对于M. smegmatis在氧化条件下的生存有一定的帮助,但是在氧化条件下TetR是结合在它自己的启动子上的,因而mazG的表达会降低(图3C-D)。这个结论同样得到前述2015年PLoS ONE上文章的支持,在氧化条件下,tetR-mfd-mazG的表达是都降低的(图3B)。这个证据进一步直接证明了那篇JBC文章上图4的实验结果是不可能发生的。

那篇JBC文章发表10年过去了,我查看了所有引用那篇文章的研究论文,没有一篇文章证实在氧化条件下,M. smegmatis体内的mazGrelA会高表达。不仅如此,对于所有研究Mycobacterium这个种属mazG基因的相关论文,我也没有看到有报道其在氧化环境下会高表达。

这段经历虽然过去大约10年了,但是对我的伤害可以说是巨大的。你们可以想象,师兄论文造假,师弟却在那里一遍又一遍的重复,长时间地呼吸着苯酚和氯仿的有毒刺激性气味,重复不出来,他就说你的实验技术不行。最后做出来了阳性结果,课题嘎然而止,造假者不仅没有得到惩治,却对我是百般欺压。你们告诉我,人性的底线在哪里?一个师兄挖了一个坑,然后师弟无意之中掉入了他挖的坑里,他每天看着你在坑里挣扎,这是人做的事情吗?如果一个人的人性如此之坏,做科研的意义是什么?在高校从事教育工作的意义是什么?

每每想起此事,我的心头就象是压着一块巨石一样,眼泪常常不由自主地就留下来。所以,我愿意把这段经历公之于众,让大家来评判,让大家来吸取教训。事件结果受到伤害的只有我和科学,科学不会说话,那就让我来说吧。

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原始发表:2021-06-06,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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