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除了pubmed, ncbi还有哪些数据库

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医学数据库百科
发布2021-07-28 14:17:06
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发布2021-07-28 14:17:06
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对于医学生而言,我们要是查询文献的话,更多使用的还是pubmed而不是web of science这样的文献检测数据库。关于pubmed,这个是属于NCBI旗下的一个文献检索网站。

但,NCBI并不是只有pubmed。它是一个全面的医学信息检索的数据库。旗下包括了各种和医学研究相关的数据库。

所以今天就挑几种笔者认为不常用但是又重要的数据库来简单的介绍一下

BioSystems

BioSystems(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/biosystems) 是一个通路相关信息查询数据库。

BioSystems汇总了类似于KEGG, GO等数据库的信息,我们只需要输入关键词就可以查询和关键词有关的信号通路。

检索之后结果的呈现和pubmed类似。同时在结果的右侧还可以看到一个对结果检索的汇总,里面提到了,检索到的结果来自于什么数据库。

其中可以看到类似KEGG这样的数据库。点击KEGG就可以得到在KEGG当中和关键词有关的结果有哪些,进一步点开随便一个结果。可以看到和通路有关的疾病信息。如果是KEGG数据库的话,还会有疾病的通路信息图。

Books

Books(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books)是一个可以免费在线访问生命科学和医疗保健方面的书籍和文件。同样的输入关键词即可返回和和关键词有关的书籍。

Conserved Domain Database

Conserved Domain Database(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/)是一个检索蛋白保守区域的数据库。

通过提供关键词,想要比对的序列或者蛋白ID即可查询其保守的结构域。

MedGen

MedGen(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/medgen/)是一个用来检索遗传性疾病有关的基因信息的数据库。通过输入疾病名称、相关基因或者临床表型来查询相关的疾病或者基因。

例如,输入身材矮小。就可以查看具体哪些基因和身材矮小有关。点开每一个疾病可以查看其具体的描述信息

Taxonomy

Taxonomy(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy/)是一个汇总了所有物种序列信息的数据库。在这里可以检索具体的物种,尤其是细菌或者病毒来查看目标物种具体的分类一个相关的序列

例如,在HBV病毒当中,可以看到具体的HBV病毒的分型。点进去就可以看到具体的信息,同时也可以连接到类似于核酸序列以及蛋白序列数据库。

总的来说

以上就是简单介绍了一个可能会用到但是又不是被提起的NCBI数据库。其他一些经典的类似OMIM, GENE, GEO, SNP, SRA这些有需要了解的。可以自己百度一下。

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原始发表:2021-07-19,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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