2021.07在线数据库汇总

在 7月期间 ，总共发表了医学相关在线数据库35 个。下面就来给大家介绍一下主要有哪些数据库，以及笔者比较感兴趣的数据库。

疾病和药物相关数据库

在这个部分，一共发表了7个数据库 。

其中 NOD数据库是一个用来预测药物新功能的数据库。对于一些经典的药物除了目前的适应症，可能还适用于其他疾病。通过NOD数据库就可以用来预测这些旧药的新功能。

微生物和病毒相关数据库

在这个部分，总共发表了4个数据库 。

其中，对于微生物16/18S测序的验证而言，就需要设计相对应的16/18S引物。pr2-primers就是一个储存16/18S引物的数据库。这里我们能检索到一些独特的16/18S引物。

DNA相关数据库

在这个部分，总共发表了5个数据库 。

其中，短开放阅读框(short open reading frames, sORF)数据库对于我们研究基因结构变异而言，又多了一个方向。MetamORF就是一个用来预测sORF的数据库

RNA相关数据库

在这个部分，总共发表了4个数据库 。

其中对于non-coding RNA而言，之前我们在[[非编码RNA分类总结]]总结过ncRNA的具体分类。但是有时候我们拿到一段序列序列想要知道这个序列是什么ncRNA怎么办呢？这个时候就可以使用ncRDense这个数据库的。这个数据库可以通过输入序列来预测序列的ncRNA类型。

蛋白相关数据库

在这个部分，总共发表了11个数据库。

其中molgpka和pKPDB是两个用来预测蛋白质pka值的数据库。

流程化分析数据库

在这个部分，总共发表了1个数据库 。

关于Rank-In简单的说一下。我们在进行高通量数据分析的时候，经常会遇到想要想要把不同平台的芯片放到一起分析或者想要把芯片和二代测序的数据放到一起分析。这个时候首先需要做的就是去除其中的批次效应。而Rank-In就是就是可以用来去除批次效应的工具。

其他方面数据库

在这个部分，总共发表了6个数据库 。

其中UCSC Cell Browser就是一个对单细胞测序数据进行可视化的工具。