AlphaFold--人类全基因组的蛋白预测！！！

AlphaFold又搞事情了，看看你是不是已经失业了。

人类基因组拥有大约20000种蛋白质。但只有大约三分之一有实验确定的三维结构。而且很多结构只是部分已知。

现在，AlphaFold已经预测了几乎整个人类蛋白质组的结构。此外，该工具还预测了各种其他生物体的几乎完整的蛋白质组，从小鼠（mice），玉米（corn）到疟原虫（ malaria parasite ）。

其数据库由EMBL-EBI所维护，其地址为：https://alphafold.ebi.ac.uk/

目前有35万多个蛋白质结构，准确性各不相同。研究人员说，将在今年年底增长到1.3亿个结构，这将可能彻底改变生命科学（旧时代与新时代的交响曲）。

伦敦大学学院的计算生物学家Christine Orengo说：“从我的角度来看，这完全是一场变革，所有这些蛋白质的形状都能让你洞察它们的作用机制。”DeepMind的联合创始人兼首席执行官Demis Hassabis表示："这是迄今为止人工智能系统对提升科学知识做出的最大贡献,我不认为这样说有什么过分。"但研究人员强调，这只是一个开始，而不是结束。他们希望验证这些预测，更重要的是，将它们应用到以前所未曾想象的实验中。这是惊人的一步。

AlphaFold预测的结构覆盖了98.5%的已知人类蛋白质和，除此之外，AlphaFold还对其预测的可信度进行了测量。”我们想给实验学家和生物学家一个真正明确的信号，告诉他们应该依赖哪一部分的预测，”Kathryn Tunyasuvunakool说，他是DeepMind的科学工程师，也是一篇描述人类蛋白质组预测的自然论文的第一作者。

DeepMind团队 预测了UniProt人类参考蛋白质组的结构（每个基因一个代表性序列），长度上限为2700个残基。最终的数据集覆盖了98.5%的人类蛋白质，并进行了全链预测。

参考：

1. https://www.nature.com/articles/d41586-021-02025-4
2. https://alphafold.ebi.ac.uk/
3. https://doi.org/10.1038/s41586-021-03828-1 (2021).