专栏首页FindKeyAlphaFold--人类全基因组的蛋白预测!!!

AlphaFold--人类全基因组的蛋白预测!!!

AlphaFold又搞事情了,看看你是不是已经失业了。

人类基因组拥有大约20000种蛋白质。但只有大约三分之一有实验确定的三维结构。而且很多结构只是部分已知。

现在,AlphaFold已经预测了几乎整个人类蛋白质组的结构。此外,该工具还预测了各种其他生物体的几乎完整的蛋白质组,从小鼠(mice),玉米(corn)到疟原虫( malaria parasite )。

其数据库由EMBL-EBI所维护,其地址为:https://alphafold.ebi.ac.uk/

目前有35万多个蛋白质结构,准确性各不相同。研究人员说,将在今年年底增长到1.3亿个结构,这将可能彻底改变生命科学(旧时代与新时代的交响曲)。

伦敦大学学院的计算生物学家Christine Orengo说:“从我的角度来看,这完全是一场变革,所有这些蛋白质的形状都能让你洞察它们的作用机制。”DeepMind的联合创始人兼首席执行官Demis Hassabis表示:"这是迄今为止人工智能系统对提升科学知识做出的最大贡献,我不认为这样说有什么过分。"但研究人员强调,这只是一个开始,而不是结束。他们希望验证这些预测,更重要的是,将它们应用到以前所未曾想象的实验中。这是惊人的一步。

AlphaFold预测的结构覆盖了98.5%的已知人类蛋白质和,除此之外,AlphaFold还对其预测的可信度进行了测量。”我们想给实验学家和生物学家一个真正明确的信号,告诉他们应该依赖哪一部分的预测,”Kathryn Tunyasuvunakool说,他是DeepMind的科学工程师,也是一篇描述人类蛋白质组预测的自然论文的第一作者。

DeepMind团队 预测了UniProt人类参考蛋白质组的结构(每个基因一个代表性序列),长度上限为2700个残基。最终的数据集覆盖了98.5%的人类蛋白质,并进行了全链预测。

参考:

  1. https://www.nature.com/articles/d41586-021-02025-4
  2. https://alphafold.ebi.ac.uk/
  3. https://doi.org/10.1038/s41586-021-03828-1 (2021).

本文分享自微信公众号 - FindKey(DrugNote),作者:ZeroDesigner

原文出处及转载信息见文内详细说明,如有侵权,请联系 yunjia_community@tencent.com 删除。

原始发表时间:2021-07-23

本文参与腾讯云自媒体分享计划,欢迎正在阅读的你也加入,一起分享。

我来说两句

0 条评论
登录 后参与评论

相关文章

  • Nature | AlphaFold预测98.5%人类蛋白结构,科学研究新范式

    2021年7月15日,DeepMind团队在Nature杂志上发表了文章"Highly accurate protein structure predictio...

    DrugAI
  • AlphaFold再登Nature封面!解锁98.5%人类蛋白质组,重要性堪比人类基因组

    同样在这周Nature期刊上,还有一篇题为《蛋白质结构预测的革命性变化》的社论文章,说明了AlphaFold的重要意义。

    新智元
  • DeepMind 再创里程碑,公开35万种蛋白质预测结构,“这”五位国内专家怎么看?

    蛋白质对于生命至关重要,几乎所有疾病,包括癌症、痴呆症都与蛋白质的结构和功能息息相关。数以亿计的蛋白质结构含有丰富的生物信息,既可以用于生物过程推理,也可以用于...

    AI科技评论
  • 成功预测98.5%人类蛋白质结构再登Nature,从头说说AlphaFold2的雄心壮志

    7月22日,DeepMind创始人哈撒比斯在官网上发布了一篇名为《把AlphaFold的力量交到全世界的手中》的文章。

    大数据文摘
  • AI解决生物学50年来重大难题:破解蛋白质折叠,颠覆结构生物学

    CASP14 组织者、年近七旬的 UC Davis 科学家 Andriy Kryshtafovych 在大会上感叹道,I wasn't sure that I ...

    科研菌
  • DeepMind的蛋白质折叠AI解决了50年来的生物学重大挑战

    蛋白质是生命的基石,负责细胞内发生的大部分事情。蛋白质的工作方式和功能由其三维形状决定-"结构即功能 "是分子生物学的公理。

    DrugAI
  • 让子弹飞 | 院士深度解析Alphafold DB的未来影响

    2021年7月22日,DeepMind和欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)联合发布了AlphaFold预测的蛋白质结构数据库,该数据库将会对生命科学和生物...

    DrugAI
  • 再看DeepMind的AI蛋白质结构预测突破:生物计算时代正在到来

    2020年11月30日,DeepMind宣布了一项重要突破:他们最新版本的AI系统AlphaFold,被CASP的组织者认定为是生物学50年来重大挑战“蛋白质折...

    智药邦
  • 生物版AlphaGo发威!DeepMind出手抗疫:预测多种新冠病毒相关蛋白结构

    DeepMind利用其最新版本的AlphaFold系统,发现几种与新冠病毒(SARS-CoV-2)相关的蛋白质的结构预测,并在今天对所有人公开。

    量子位
  • 谷歌提前开源AlphaFold 2!Nature、Science同时公开两大蛋白质结构预测工具

    nature和Science两本杂志一直相爱相杀,总是喜欢争着发表科学领域中的重大发现、重要突破,抢夺大师文章的发表版权。

    昱良
  • Nat Rev Drug Discov|AlphaFold对药物发现意味着什么?

    2021年9月14日,Nature Reviews Drug Discovery杂志发表文章,多位专家探讨了AlphaFold对于药物发现的意义。

    智药邦
  • AlphaGo后再出神作!DeepMind打造AlphaFold击败人类,精度碾压人类专家!

    还记得在围棋上碾压人类棋手的AlphaGo吗?现在,AlphaGo的缔造者DeepMind又再另一领域碾压了人类专家。

    新智元
  • Nature社论|结构生物学中的人工智能将会继续

    2021年7月27日,Nature发表社论,对近期AlphaFold的热点报道进行了点评。

    智药邦
  • 下一站:AlphaDrug?

    “依我之见,AlphaFold是人工智能对科学领域最大的一次贡献,也是人类在 21 世纪取得的最重要的科学突破之一” ——施一公。

    DrugAI
  • AlphaGo之后,DeepMind重磅推出AlphaFold:基因序列预测蛋白质结构

    DeepMind 表示,AlphaFold 是「该公司首个证明人工智能研究可以驱动和加速科学新发现的重要里程碑」。看来,人类医学研究要前进一步了。

    机器之心
  • DeepMind攻破生物学领域50年难题:蛋白质结构预测准确性可达92.4分

    导语:蛋白质的形状与其功能密切相关,能够预测这种结构可使人们更好地了解它的功能和工作原理,从而突破世界上许多强有力的挑战,如开发疾病治疗方法或寻找分解工业废物的...

    AI科技大本营
  • DeepMind研制出可准确预测蛋白质结构的AlphaFold

    谷歌旗下公司DeepMind最新研制出的人工高智能系统AlphaFold在蛋白质结构预测技术评估试验CASP(Critical Assessment of St...

    人工智能快报
  • 悲剧 or 春天?AlphaFold究竟给结构生物学家带来了什么?

    AlphaFold 在 2020 年的蛋白质折叠挑战赛中表现非常出色,也吸引了很多注意力。最近,研究团队又宣布即将公开他们所预测的 35 万种蛋白质的结构,而且...

    机器之心
  • Nature Methods | 深度学习蛋白质三维结构

    nature methods副主编,Arunima Singh,3月4日在nature methods上发表文章,探讨了基于深度学习的蛋白质结构预测方向近期的研...

    DrugAI

扫码关注云+社区

领取腾讯云代金券