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绘图资源sthda推荐

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生信技能树
发布2021-10-12 12:14:11
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发布2021-10-12 12:14:11
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昨天在《生信技能树》公众号分享了 绘图资源rpubs推荐 ,引起了大家的兴趣,读者纷纷留言表示希望可以多推荐类似的资源。

其实我们做分享这近十年,很多资源都是反复分享了,只不过呢很多小伙伴都是关注咱们《生信技能树》时间不长,所以很有必要再次把以前推荐的资料重新发一次。比如:sthda网站的ggplot核心图表示例:

链接:http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-essentials

书籍本身提供售卖,价格是17欧元,不过内容都是电子化了,大家直接网页浏览,就是免费的哈!图表很丰富:

  • Create Scatter plots to display the relationship between two continuous variables x and y
  • Using Box plots and alternatives to visualize data grouped by the levels of a categorical variable
  • Bar and Line Plots
  • Visualizing error bars
  • Inspecting the distribution of a continuous variable using density plots, histograms and alternatives

价格是17欧元

发现他们居然有大量的统计可视化书籍:

  • Practical Guide to Cluster Analysis in R by A. Kassambara (Datanovia)
  • Practical Guide To Principal Component Methods in R by A. Kassambara (Datanovia)
  • Machine Learning Essentials: Practical Guide in R by A. Kassambara (Datanovia)
  • R Graphics Essentials for Great Data Visualization by A. Kassambara (Datanovia)
  • GGPlot2 Essentials for Great Data Visualization in R by A. Kassambara (Datanovia)
  • Network Analysis and Visualization in R by A. Kassambara (Datanovia)
  • Practical Statistics in R for Comparing Groups: Numerical Variables by A. Kassambara (Datanovia)
  • Inter-Rater Reliability Essentials: Practical Guide in R by A. Kassambara (Datanovia)

其实它的底层仍然是ggplot系列

但是如果你要从ggplot2开始一步步调制成为它这样的美图,需要的功力很深。

一张统计图就是从数据到几何对象(点、线、条形等)的图形属性(颜色、形状、大小等)的一个映射。

  • ✦ 数据(Data),最基础的是可视化的数据和一系列图形映射(aesthetic mappings),该映射描述了数据中的变量如何映射到可见的图形属性。
  • ✦ 几何对象(Geometric objects, geoms)代表在图中实际看到的点、线、多边形等。
  • ✦ 统计转换(Statistical trassformations, stats)是对数据进行某种汇总,例如将数据分组创建直方图,或将一个二维的关系用线性模型进行解释。
  • ✦ 标度(Scales)是将数据的取值映射到图形空间,例如用颜色、大小或形状来表示不同的取值,展现标度的常见做法是绘制图例和坐标轴。
  • ✦ 坐标系(Coordinate system, coord)描述数据是如何映射到图形所在的平面,同时提供看图所需的坐标轴和网格线。
  • ✦ 分面(faceting)如何将数据分解为子集,以及如何对子集作图并展示。
  • ✦ 主题(theme)控制细节显示,例如字体大小和图形的背景色。
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原始发表:2021-10-05,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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