读《Single Cell Biomedicine》

跟着运来兄搭建自己的生物信息小书房。趁年轻，读几本硬书，到老了慢慢反刍。

闲暇时，在书库里面搜索的时候看到了这本书：Single Cell Biomedicine，也是Xiangdong Wang 老师参编的。这几年，王老师在单细胞领域可谓是笔耕不辍：

单细胞技术是指面向单个细胞的分析技术合集，我们提过，它是一个应用层面。流式细胞是不是单细胞？是的，只是通量没有那么高。不能手里拿着锤子就看什么都是钉子，也不能一看到Single Cell 就想到scRNA,scVDJ，scATAC，应该想到在微环境中活生生的，细胞间相互交流，细胞内各种调控的细胞生态。

高通量的细胞技术（微流控+NGS）为我们在单细胞水平上看基因的调控、表达、翻译等信息，为我研究疾病机理提供了新的工具与视角。为什么单细胞技术是里程碑的呢？首先看里程碑在哪：个体，器官，组织，细胞，细胞器，生物分子。细胞处在这链条的中间位置：向上承接组织细胞类型，向下承接亚细胞单位。

而，单细胞作为生物器官和组织的基本单位，近年来被认为是进一步了解器官功能和生物学的分子机制的一个重要窗口。随着单细胞生物技术的发展，单细胞生物医学越来越成为了解细胞间异质性、识别疾病特异性生物标志物、探索分子调控和信号的重要领域。单细胞系统生物学是强调作为一种方法来理解单细临床表型，单细胞生物学，异质性。多维度、多层、多交叉和立体的单细胞生物学必将有利于疾病特异性生物标志物的发现和开发、将单细胞系统生物学转化为临床表型、理解单细胞基因测序和患者对治疗反应的功能。作为单细胞生物医学的一部分，单细胞RNA测序(scRNAseq)被用作定义转录组的改变、瘤内和细胞间异质性的发展以及响应的基因毒性的关键和初始工具。

癌症的异质性可以通过单细胞测序和癌症细胞的全面分子特征来描述，包括遗传和体细胞的基因变化和突变。肿瘤细胞异质性的特异性、表征和作用决定了细胞对治疗的敏感性和耐药性，并被认为是基于提出的精确的自我验证系统开发靶向驱动疗法和临床试验策略的关键因素。

当然，单细胞不是终点。或者说，它只是展开了一个新的画卷。这是一项医学驱动的技术，所以他的学术，他的应用基本也都是面向临床的：机理与应用。以往的研究，特别是对异质性较强的癌症的研究，基于组织可能只能分型分期，到单细胞这可以看到每个癌细胞的状态。这里我们不禁要引用一句话：

If you can not see it ， you can not stop it.

单细胞技术正好是一项 see it 的技术，我们可以中各个侧面看到单个细胞的性质，如基因的表达调控。虽然目前还都是没有离开中心法则，单细胞像是人口普查，为我们提供一个全景的概览，以便我们可以找到新的方向。

生物医学（Biomedicine）这个单词的核心是个体，根本是细胞。所以单细胞技术可以说是一个分界点，到亚细胞结构的研究偏向生物物理或者生物化学。单细胞技术的商业化，在2020年来看是学术界和产业界一同发展的。有不少科研院所的技术走出象牙塔挤进大教堂，这也是一个特点。

本书是编著，所以是围绕Single Cell Biomedicine这个主题几位专家展开的讨论。开卷是有益的，看大牛们的讨论，形成自己的思考。单细胞打开了一个维度，巧的是，单细胞本身也是一个维度。

感兴趣的章节我做了标注，不知道你有没用看到呢？