绘图资源sthda推荐

昨天在《生信技能树》公众号分享了 绘图资源rpubs推荐 ，引起了大家的兴趣，读者纷纷留言表示希望可以多推荐类似的资源。

其实我们做分享这近十年，很多资源都是反复分享了，只不过呢很多小伙伴都是关注咱们《生信技能树》时间不长，所以很有必要再次把以前推荐的资料重新发一次。比如：sthda网站的ggplot核心图表示例：

链接：http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-essentials

书籍本身提供售卖，价格是17欧元，不过内容都是电子化了，大家直接网页浏览，就是免费的哈！图表很丰富：

• Create Scatter plots to display the relationship between two continuous variables x and y
• Using Box plots and alternatives to visualize data grouped by the levels of a categorical variable
• Bar and Line Plots
• Visualizing error bars
• Inspecting the distribution of a continuous variable using density plots, histograms and alternatives

价格是17欧元

发现他们居然有大量的统计可视化书籍：

• Practical Guide to Cluster Analysis in R by A. Kassambara (Datanovia)
• Practical Guide To Principal Component Methods in R by A. Kassambara (Datanovia)
• Machine Learning Essentials: Practical Guide in R by A. Kassambara (Datanovia)
• R Graphics Essentials for Great Data Visualization by A. Kassambara (Datanovia)
• GGPlot2 Essentials for Great Data Visualization in R by A. Kassambara (Datanovia)
• Network Analysis and Visualization in R by A. Kassambara (Datanovia)
• Practical Statistics in R for Comparing Groups: Numerical Variables by A. Kassambara (Datanovia)
• Inter-Rater Reliability Essentials: Practical Guide in R by A. Kassambara (Datanovia)

其实它的底层仍然是ggplot系列

但是如果你要从ggplot2开始一步步调制成为它这样的美图，需要的功力很深。

一张统计图就是从数据到几何对象（点、线、条形等）的图形属性（颜色、形状、大小等）的一个映射。

• ✦ 数据（Data），最基础的是可视化的数据和一系列图形映射（aesthetic mappings），该映射描述了数据中的变量如何映射到可见的图形属性。
• ✦ 几何对象（Geometric objects, geoms）代表在图中实际看到的点、线、多边形等。
• ✦ 统计转换（Statistical trassformations, stats）是对数据进行某种汇总，例如将数据分组创建直方图，或将一个二维的关系用线性模型进行解释。
• ✦ 标度（Scales）是将数据的取值映射到图形空间，例如用颜色、大小或形状来表示不同的取值，展现标度的常见做法是绘制图例和坐标轴。
• ✦ 坐标系（Coordinate system, coord）描述数据是如何映射到图形所在的平面，同时提供看图所需的坐标轴和网格线。
• ✦ 分面（faceting）如何将数据分解为子集，以及如何对子集作图并展示。
• ✦ 主题（theme）控制细节显示，例如字体大小和图形的背景色。

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