Linux编程学习--文本处理（正则表达，sed，while循环）

下面是11月学员的投稿

最近批量下载了ICGC数据库资料，数据库长这样：

下载的数据长这样,存放在我的/bioinformatics/ICGC/SpecimenCentric文件下：

(base)mk@mk:/bioinformatics/ICGC/SpecimenCentric$ ls

发现每个文件名的前缀奇怪的的命名，每个文件最前面多了 sp%2F字符。当然，对于使用惯windows的童鞋，当然是右键→重命名，一个个重复命名就好了。好在文件总共11个，一个个右键重命名也不外乎一两分钟的事。但是问题来了，要是下载的文件成百上千，甚至上万个呢？还是这样笨拙的一个个右键→重命名？跟过Jimmy老师学习过都知道，当然是编程思维解决问题啦。我使用的是Ubuntu Kylin，于是乎，废话不多说，开始实操。

思维就是，grep把"sp%2F"适配出来，然后sed批量替换，最后通过while循环，mv批量重命名。

第一步:需要注意 %符号，要用反斜杠（\）转义

ls|grep 'sp\%2F'

ls|grep 'sp\%2F'|sed s/sp\%2F//g

把最终想要的文件名重定向于file.txt,并查看file.txt，确认最终想要的文件名称。

ls|grep 'sp\%2F'|sed s/sp\%2F//g >file.txt

cat file.txt

第二步，把‘sp%2F’赋值给变量a，方便后续调用(注意，此时不需要转义符（\））。

a='sp%2F'

第三步，检查并构建最后批量重命名命令(mv,while,变量调用)，确保无误：

cat file.txt|while read id;do echo "mv $a$id $id";done

可见，变量

id顺利正确调用，mv命令后面旧新文件完全匹配正确。

第四步：把构建好的最终批量调用的命令重定向至file2.txt，后续while循环读取。此时需要会用vim编辑器。

touch file2.txt;vim file2.txt

最后，开始批量完成最终操作：

cat file2.txt|while read id;do $id;done

最后ls检查最终结果：

大功告成。

心得：正如Jimmy老师所说，编程的能力就是解决实际问题能力。要善于发现规律，通过共有规律来批量操作。

大家赶紧去Linux命令行测试一下吧！