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社区首页 >专栏 >MIMIC III数据集详细介绍

MIMIC III数据集详细介绍

作者头像
bboy枫亭
发布2021-12-07 15:34:42
发布2021-12-07 15:34:42
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文章被收录于专栏:csdn_blog

文章目录

1. 概述

多参数智能监测数据库(MIMIC-III)是一个免费开放的、公共资源的重症监护室研究数据库。该数据库于2006年由美国麻省理工学院计算生理学实验室以及贝斯以色列迪康医学中心(BIDMC)和飞利浦医疗共同发布,吸引了越来越多的学术界和工业界的研究人员采用该医疗数据库从事医疗研究。

MIMIC数据集包括MIMIC-II数据集和MIMIC-III数据集,MIMIC-II数据集的数据是2001—2008年间贝斯以色列迪康医学中心(BIDMC)重症监护室中病人的医疗数据,MIM-IC-III数据集的数据是2001年6月—2012年10月重症监护室病人数据。数据集MIMIC数据库从发布到现在,随着更多数据变得可用,数据导入和提取方法的改进,以及数据库维护人员一直根据社区提供的数据库内容的反馈定期更新数据集,因此MIMIC数据集有多个版本,目前最新的版本是2016年9月发布的MIMIC-IIIV1.4。

MIMIC数据库中包含了多种类型ICU(外科监护室、内科监护室、创伤外科监护室、新生儿监护室、心脏病监护室、心外恢复监护室)。MIMIC-Ⅲ数据集主要包括波形数据集(病人的生命体征趋势图)和临床数据集,按照记录内容的不同,共包含以下21个数据表:住院表、出院表、当前使用医疗服务记录表(CPT)、日期型事件表、医务人员表、监测情况表、ICD病情确诊表、诊断相关组编码表(DRG)、ICU记录表、注射记录表(CV)、注射记录表(MV)、排泄记录表、化验记录表、微生物检测记录表、文本报告记录表、病人登记表、处方信息表、过程事件表(MV)、ICD手术记录表、服务表、病房转移表。同时,数据集中还包含了5个辅助表用来辅助查找:目前使用医疗服务术语表、ICD病情确诊词典表、ICD医疗过程词典表、ICU化验词典表、门诊化验词典表。在对26个数据表的内容充分了解后,按照各个表的内容相关程度可分为四类,分别是病人基本信息及转移信息表、病人医院门诊的治疗相关信息表、病人在ICU里的治疗相关信息表和辅助信息表。下面分别介绍数据表的主要内容和利用该数据表进行的相关研究。

2. 字典信息辅助表

字典信息数据,共包含5个数据表。抽取患者的数据比如说生命体征,心率等,实验室指标(如白细胞红细胞等)等, 需要在相应的字典中找到相应的item,即项目标识符,再对应查找某一个患者对应指标下的数据。

{% asset_img 4.png %}

D_CPT(目前使用医疗服务术语表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

行号

CATEGORY

SMALLINT

CPT code 类别号

SECTIONRANGE

VARCHAR(100)

给定的代码范围

SECTIONHEADER

VARCHAR(50)

给定的代码说明

SUBSECTIONRANGE

VARCHAR(100)

对给定子部分的代码范围

SUBSECTIONHEADER

VARCHAR(300)

对给定子部分的描述

CODESUFFIX

VARCHAR(5)

当CPT_CD包含非数字字符时,CPT_SUFFIX列包含文本后缀

MINCODEINSUBSECTION

INT

SUBSECTIONRANGE 的最小值

MAXCODEINSUBSECTION

INT

SUBSECTIONRANGE 的最大值

D_ICD_DIAGNOSES (ICD病情确诊词典表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

ICD9_CODE

VARCHAR(10)

ICD-9 编码

SHORT_TITLE

VARCHAR(50)

缩写(对给定代码的简单描述)

LONG_TITLE

VARCHAR(300)

全称

D_ICD_PROCEDURES (ICD医疗过程词典表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

ICD9_CODE

VARCHAR(10)

ICD-9 编码

SHORT_TITLE

VARCHAR(50)

缩写

LONG_TITLE

VARCHAR(300)

全称

D_ITEMS(ICU化验词典表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

ITEMID

INT

项目标识符

LABEL

VARCHAR(200)

项目标签

ABBREVIATION

VARCHAR(100)

标签缩写

DBSOURCE

VARCHAR(20)

数据来源

LINKSTO

VARCHAR(50)

对应的数据表

CATEGORY

VARCHAR(100)

项目种类

UNITNAME

VARCHAR(100)

项目测量单位

PARAM_TYPE

VARCHAR(30)

记录数据的类型 a date, a number, a text field

CONCEPTID

INT

未知,数据表中该列全为空

D_LABITEMS(门诊化验词典表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

ITEMID

INT

实验室检测项目的ITEMID

LABEL

VARCHAR(100)

项目标签

FLUID

VARCHAR(100)

测量的物质 ‘blood’ ‘urine’

CATEGORY

VARCHAR(100)

测量的种类

LOINC_CODE

VARCHAR(100)

LOINC_CODE包含与给定ITEMID关联的LOINC代码。 LOINC是一种本体,最初指定了实验室测量,但后来扩展到涵盖了广泛的临床相关概念。 LOINC公开提供一个表,其中包含有关每个LOINC代码的大量详细信息。 该表可在线免费获取,也可由数据库的监护人提供

3. 病人基本信息及转移信息表

{% asset_img 1.png %}

PATIENTS(病人登记表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

患者编号

GENDER

VARCHAR(5)

性别

DOB

TIMESTAMP(0)

出生日期

DOD

TIMESTAMP(0)

死亡日期

DOD_HOSP

TIMESTAMP(0)

院内登记死亡日期

DOD_SSN

TIMESTAMP(0)

社保局登记死亡日期

EXPIRE_FLAG

VARCHAR(5)

死亡标记

ADMISSIONS(住院表)

Name Postgres data type

说明

ROW_ID INT

行号

SUBJECT_ID INT

患者编号

HADM_ID INT

病案号

ADMITTIME TIMESTAMP(0)

入院时间

DISCHTIME TIMESTAMP(0)

出院时间

DEATHTIME TIMESTAMP(0)

死亡时间

ADMISSION_TYPE VARCHAR(50)

入院类型

ADMISSION_LOCATION VARCHAR(50)

入院地点

DISCHARGE_LOCATION VARCHAR(50)

出院地点

INSURANCE VARCHAR(255)

保险类型

LANGUAGE VARCHAR(10)

语种

RELIGION VARCHAR(50)

宗教信仰

MARITAL_STATUS VARCHAR(50)

婚姻状况

ETHNICITY VARCHAR(200)

种族

EDREGTIME TIMESTAMP(0)

急诊留观登记时间

EDOUTTIME TIMESTAMP(0)

急诊留观出观时间

DIAGNOSIS VARCHAR(300)

初步诊断

HOSPITAL_EXPIRE_FLAG TINYINT

院内死亡标记

HAS_CHARTEVENTS_DATA TINYINT

是否有chartevents记录

CALLOUT(出院表)

Name Postgres data type

说明

ROW_ID INT

行号

SUBJECT_ID INT

患者编号

HADM_ID INT

病案号

SUBMIT_WARDID INT

提交申请的科室代码

SUBMIT_CAREUNIT VARCHAR(15)

提交申请的科室所属的ICU cost类型

CURR_WARDID INT

患者所属科室

CURR_CAREUNIT VARCHAR(15)

患者所属的ICU cost类型

CALLOUT_WARDID INT

申请转移的地方 0 代表 Home / 1 代表转移到可用的的病房

CALLOUT_SERVICE VARCHAR(10)

患者需接受的治疗服务

REQUEST_TELE SMALLINT

预防患者已经感染的疾病

REQUEST_RESP SMALLINT

预防患者已经感染的疾病

REQUEST_CDIFF SMALLINT

预防患者已经感染的疾病

REQUEST_MRSA SMALLINT

预防患者已经感染的疾病

REQUEST_VRE SMALLINT

预防患者已经感染的疾病

CALLOUT_STATUS VARCHAR(20)

申请的状态

CALLOUT_OUTCOME VARCHAR(20)

‘Discharged’ or ‘Cancelled’

DISCHARGE_WARDID INT

实际转移的地方 0 代表 Home / 1 代表转移到可用的的病房

ACKNOWLEDGE_STATUS VARCHAR(20)

申请的反馈结果状态 ‘Acknowledged’, ‘Revised’, ‘Unacknowledged’ or ‘Reactivated’

CREATETIME TIMESTAMP(0)

申请创建时间

UPDATETIME TIMESTAMP(0)

更新时间

ACKNOWLEDGETIME TIMESTAMP(0)

反馈时间

OUTCOMETIME TIMESTAMP(0)

callout完成时间

FIRSTRESERVATIONTIME TIMESTAMP(0)

首次病房保留时间

CURRENTRESERVATIONTIME TIMESTAMP(0)

当前病房保留时间

ICUSTAYS(ICU记录表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

指定患者的标识符

HADM_ID

INT

对于患者而言HADM_ID是唯一的

ICUSTAY_ID

INT

ICU病案号(对于患者住院而言ICUSTAY_ID是唯一的)

DBSOURCE

VARCHAR(20)

来源数据库 ‘carevue’ ‘metavision’ 在某些地方处理上有所不同

FIRST_CAREUNIT

VARCHAR(20)

患者入住监护室24小时内的首个ICU监护室种类

LAST_CAREUNIT

VARCHAR(20)

患者入住监护室24小时内的最终ICU监护室种类

FIRST_WARDID

SMALLINT

监护室编号

LAST_WARDID

SMALLINT

监护室编号

INTIME

TIMESTAMP(0)

入科时间

OUTTIME

TIMESTAMP(0)

出科时间

LOS

DOUBLE

入住时长 可能包括单个或多个ICU单位

TRANSFERS(病房转移表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

-

HADM_ID

INT

-

ICUSTAY_ID

INT

-

DBSOURCE

VARCHAR(20)

数据来源 ‘carevue’ ‘metavision’

EVENTTYPE

VARCHAR(20)

转移的类型 ‘admit’ ‘transfer’ ‘discharge’

PREV_CAREUNIT

VARCHAR(20)

前次所在监护室

CURR_CAREUNIT

VARCHAR(20)

当前所在监护室

PREV_WARDID

SMALLINT

前次所在科室代码

CURR_WARDID

SMALLINT

当前所在科室代码

INTIME

TIMESTAMP(0)

入科时间

OUTTIME

TIMESTAMP(0)

出科时间

LOS

INT

住院时长

SERVICES(服务表)

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

-

HADM_ID

INT

-

TRANSFERTIME

TIMESTAMP(0)

服务种类更改时间

PREV_SERVICE

VARCHAR(20)

前次服务种类

CURR_SERVICE

VARCHAR(20)

当前服务种类

服务的名称缩写及其详细说明:

Service

Description

CMED

Cardiac Medical - for non-surgical cardiac related admissions

CSURG

Cardiac Surgery - for surgical cardiac admissions

DENT

Dental - for dental/jaw related admissions

ENT

Ear, nose, and throat - conditions primarily affecting these areas

GU

Genitourinary - reproductive organs/urinary system

GYN

Gynecological - female reproductive systems and breasts

MED

Medical - general service for internal medicine

NB

Newborn - infants born at the hospital

NBB

Newborn baby - infants born at the hospital

NMED

Neurologic Medical - non-surgical, relating to the brain

NSURG

Neurologic Surgical - surgical, relating to the brain

OBS

Obstetrics - conerned with childbirth and the care of women giving birth

ORTHO

Orthopaedic - surgical, relating to the musculoskeletal system

OMED

Orthopaedic medicine - non-surgical, relating to musculoskeletal system

PSURG

Plastic - restortation/reconstruction of the human body (including cosmetic or aesthetic)

PSYCH

Psychiatric - mental disorders relating to mood, behaviour, cognition, or perceptions

SURG

Surgical - general surgical service not classified elsewhere

TRAUM

Trauma - injury or damage caused by physical harm from an external source

TSURG

Thoracic Surgical - surgery on the thorax, located between the neck and the abdomen

VSURG

Vascular Surgical - surgery relating to the circulatory system

4. 病人医院门诊治疗的相关信息表

{% asset_img 2.png %}

CPTEVENTS(当前使用医疗服务记录表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

行号

SUBJECT_ID

INT

患者编号

HADM_ID

INT

病案号

COSTCENTER

VARCHAR(10)

操作部门

CHARTDATE

TIMESTAMP(0)

操作时间

CPT_CD

VARCHAR(10)

操作的原始编码code

CPT_NUMBER

INT

CPT_CD 的数字信息

CPT_SUFFIX

VARCHAR(5)

CPT_CD 的文本后缀

TICKET_ID_SEQ

INT

CPT_CD 的顺序

SECTIONHEADER

VARCHAR(50)

CPT_CD 的种类

SUBSECTIONHEADER

VARCHAR(300)

CPT_CD 的种类

DESCRIPTION

VARCHAR(200)

CPT_CD 的详细信息

DIAGNOSES_ICD(诊断信息表)

Name

PostgreSQL data type

Modifiers

说明

ROW_ID

INT

not null

-

SUBJECT_ID

INT

not null

-

HADM_ID

INT

not null

-

SEQ_NUM

INT

ICD诊断顺序

ICD9_CODE

VARCHAR(10)

实际编码IDC-9

DRGCODES(诊断相关组编码表)

Name

PostgreSQL data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

-

HADM_ID

INT

-

DRG_TYPE

VARCHAR(20)

诊断类别

DRG_CODE

VARCHAR(20)

诊断编码

DESCRIPTION

VARCHAR(300)

详细描述

DRG_SEVERITY

SMALLINT

严重程度

DRG_MORTALITY

SMALLINT

死亡率

LABEVENTS(门诊检查记录表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

-

HADM_ID

INT

-

ITEMID

INT

项目标识符

CHARTTIME

TIMESTAMP(0)

测量时间

VALUE

VARCHAR(200)

测量项目

VALUENUM

DOUBLE PRECISION

测量数值数据

VALUEUOM

VARCHAR(20)

测量单位

FLAG

VARCHAR(20)

测量值是否异常

MICROBIOLOGYEVENTS(微生物检测记录表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

-

HADM_ID

INT

-

CHARTDATE

TIMESTAMP(0)

记录日期

CHARTTIME

TIMESTAMP(0)

记录时间

SPEC_ITEMID

INT

化验项目标识符

SPEC_TYPE_DESC

VARCHAR(100)

化验类型 血液 尿液 痰

ORG_ITEMID

INT

生成的有机物标识符

ORG_NAME

VARCHAR(100)

有机物名称

ISOLATE_NUM

SMALLINT

分离菌落数目

AB_ITEMID

INT

抗生素敏感性测试标识符

AB_NAME

VARCHAR(30)

抗生素名称

DILUTION_TEXT

VARCHAR(10)

测试抗生素敏感性

DILUTION_COMPARISON

VARCHAR(20)

-

DILUTION_VALUE

DOUBLE PRECISION

测试抗生素敏感性时的稀释值

INTERPRETATION

VARCHAR(5)

解释抗生素的敏感性和试验结果 “S”是敏感的,“R”是抗性的,“I”是中间的,“P”是待定的

PRESCRIPTIONS(处方信息表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

-

HADM_ID

INT

-

ICUSTAY_ID

INT

-

STARTDATE

TIMESTAMP(0)

用药开始时间

ENDDATE

TIMESTAMP(0)

用药结束时间

DRUG_TYPE

VARCHAR(100)

药物类型

DRUG

VARCHAR(100)

药物名称

DRUG_NAME_POE

VARCHAR(100)

药物说明

DRUG_NAME_GENERIC

VARCHAR(100)

药物说明

FORMULARY_DRUG_CD

VARCHAR(120)

处方药代码

GSN

VARCHAR(200)

通用序列号

NDC

VARCHAR(120)

国家药品编码

PROD_STRENGTH

VARCHAR(120)

-

DOSE_VAL_RX

VARCHAR(120)

-

DOSE_UNIT_RX

VARCHAR(120)

-

FORM_VAL_DISP

VARCHAR(120)

-

FORM_UNIT_DISP

VARCHAR(120)

-

ROUTE

VARCHAR(120)

-

PROD_STRENGTH

DOSE_VAL_RX, DOSE_UNIT_RX

FORM_VAL_DISP, FORM_UNIT_DISP

ROUTE

The route prescribed for the drug.

为该药开出的途径

5. 病人在ICU里的治疗相关信息表

{% asset_img 3.png %}

CAREGIVERS(医务人员信息表)

Name Postgres data type

说明

ROW_ID INT

行号

CGID INT

护理人员标志符

LABEL VARCHAR(15)

护理人员的头衔 RN, MD, PharmD

DESCRIPTION VARCHAR(30)

护理人员的结构化数据信息 17 unique values

CHARTEVRNTS(化验记录表)

Name

Postgres data type

In CareVue

In Metavision

说明

ROW_ID

INT

Y

Y

行号

SUBJECT_ID

NUMBER(7,0)

Y

Y

患者编号

HADM_ID

NUMBER(7,0)

Y

Y

病案号

ICUSTAY_ID

NUMBER(7,0)

Y

Y

ICU病案号

ITEMID

NUMBER(7,0)

Y

Y

项目标识符

CHARTTIME

DATE

Y

Y

记录时间

STORETIME

DATE

Y

Y

存储时间

CGID

NUMBER(7,0)

Y

Y

护理人员标识符

VALUE

VARCHAR2(200 BYTE)

Y

Y

项目测量的值

VALUENUM

NUMBER

Y

Y

项目测量的数字信息

VALUEUOM

VARCHAR2(20 BYTE)

Y

Y

项目测量的值对应的单位

WARNING

NUMBER(1,0)

Y

测量过程发生的警告 / Metavision specific columns

ERROR

NUMBER(1,0)

Y

测量过程发生的错误 / Metavision specific columns

RESULTSTATUS

VARCHAR2(20 BYTE)

Y

测量类型 ‘Manual’ or ‘Automatic’ / CareVue specific columns

STOPPED

VARCHAR2(20 BYTE)

Y

测量是否停止

DATETIMEEVENTS (日期型事件表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

行号

SUBJECT_ID

INT

患者编号

HADM_ID

INT

病案号

ICUSTAY_ID

INT

ICU病案号

ITEMID

INT

项目标识符

CHARTTIME

TIMESTAMP(0)

记录时间

STORETIME

TIMESTAMP(0)

存储时间

CGID

INT

护理人员标识符

VALUE

TIMESTAMP(0)

项目测量的值

VALUEUOM

VARCHAR(50)

项目测量的值对应的单位

WARNING

SMALLINT

测量过程发生的警告 / Metavision specific columns

ERROR

SMALLINT

测量过程发生的错误 / Metavision specific columns

RESULTSTATUS

VARCHAR(50)

测量类型 ‘Manual’ or ‘Automatic’ / CareVue specific columns

STOPPED

VARCHAR(50)

测量是否停止

INPUTEVENTS(注射事件表(CV))

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

-

HADM_ID

INT

-

ICUSTAY_ID

INT

-

CHARTTIME

TIMESTAMP(0)

记录时间

ITEMID

INT

项目标识符

AMOUNT

DOUBLE PRECISION

总入量

AMOUNTUOM

VARCHAR(30)

入量单位

RATE

DOUBLE PRECISION

给药速率

RATEUOM

VARCHAR(30)

速率单位

STORETIME

TIMESTAMP(0)

存储时间

CGID

BIGINT

护理人员编码

ORDERID

BIGINT

同一次输入的多个药物进行链接

LINKORDERID

BIGINT

同一次的单个药物不同改变进行链接

STOPPED

VARCHAR(30)

输入是否暂停

NEWBOTTLE

INT

新配制的溶液

ORIGINALAMOUNT

DOUBLE PRECISION

-

ORIGINALAMOUNTUOM

VARCHAR(30)

-

ORIGINALROUTE

VARCHAR(30)

-

ORIGINALRATE

DOUBLE PRECISION

-

ORIGINALRATEUOM

VARCHAR(30)

-

ORIGINALSITE

VARCHAR(30)

-

ORIGINALAMOUNT, ORIGINALAMOUNTUOM, ORIGINALROUTE, ORIGINALRATE, ORIGINALRATEUOM , ORIGINALSITE

这些列提供有关药物首次输入信息系统时所使用的解决方案的信息

INPUTEVENTS_MV (注射事件表(MV))

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

-

HADM_ID

INT

-

ICUSTAY_ID

INT

-

STARTTIME

TIMESTAMP(0)

入量开始时间

ENDTIME

TIMESTAMP(0)

入量结束时间

ITEMID

INT

项目标识符

AMOUNT

DOUBLE PRECISION

总入量

AMOUNTUOM

VARCHAR(30)

入量单位

RATE

DOUBLE PRECISION

给药速率

RATEUOM

VARCHAR(30)

速率单位

STORETIME

TIMESTAMP(0)

存储时间

CGID

BIGINT

护理人员编号

ORDERID

BIGINT

同上

LINKORDERID

BIGINT

同上

ORDERCATEGORYNAME

VARCHAR(100)

-

SECONDARYORDERCATEGORYNAME

VARCHAR(100)

-

ORDERCOMPONENTTYPEDESCRIPTION

VARCHAR(200)

-

ORDERCATEGORYDESCRIPTION

VARCHAR(50)

-

PATIENTWEIGHT

DOUBLE PRECISION

患者体重 (kg)

TOTALAMOUNT

DOUBLE PRECISION

溶液液体总量

TOTALAMOUNTUOM

VARCHAR(50)

溶液液体总量单位

ISOPENBAG

SMALLINT

-

CONTINUEINNEXTDEPT

SMALLINT

转移是否继续入量

CANCELREASON

SMALLINT

取消原因

STATUSDESCRIPTION

VARCHAR(30)

项目最终状态 changed paused finishedrunning stopped rewritten flushed

COMMENTS_STATUS

VARCHAR(30)

-

COMMENTS_TITLE

VARCHAR(100)

-

COMMENTS_DATE

TIMESTAMP(0)

-

ORIGINALAMOUNT

DOUBLE PRECISION

-

ORIGINALRATE

DOUBLE PRECISION

-

COMMENTS_STATUS, COMMENTS_TITLE, COMMENTS_DATE

指定是编辑还是取消订单,如果是,则指定取消或编辑该订单的护理员的日期和职位。

ORIGINALAMOUNT

通常将药物混合在溶液中,并从同一袋子连续输送。此栏代表处袋子中所含药物的数量STARTTIME。对于第一次注入一个新袋子,ORIGINALAMOUNT= TOTALAMOUNT。以后,如果速率改变了,那么袋子中的药物量就会减少(因为有些药物已经施予患者了)。结果,ORIGINALAMOUNT<TOTALAMOUNTORIGINALAMOUNT将是该处袋子中剩余药物的数量STARTTIME

ORIGINALRATE

这是护理人员输入的费率。请注意,这可能RATE由于各种原因而有所不同:ORIGINALRATE是原始计划费率,而RATE列将是实际交付的费率。例如,如果一个袋子快要用完了,而护理人员决定将剩余的液体推入,则RATE> ORIGINALRATE。但是,这两列通常是相同的,但由于四舍五入误差,在临床上的差别很小。

NOTEEVENTS (文本记录事件表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

-

HADM_ID

INT

-

CHARTDATE

TIMESTAMP(0)

记录note的日期

CHARTTIME

TIMESTAMP(0)

记录note的日期和时间

STORETIME

TIMESTAMP(0)

记录note保存到系统的日期和时间

CATEGORY

VARCHAR(50)

记录类型 ‘Discharge’ :出院

DESCRIPTION

VARCHAR(300)

记录类别 ‘Summary’ :总结

CGID

INT

护理人员标识符

ISERROR

CHAR(1)

‘1’ 代表该记录被标记为错误

TEXT

TEXT

医嘱内容

OUTPUTEVENTS (排泄记录表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT

-

SUBJECT_ID

INT

-

HADM_ID

INT

-

ICUSTAY_ID

INT

-

CHARTTIME

TIMESTAMP(0)

时间

ITEMID

INT

项目标识符

VALUE

DOUBLE PRECISION

出量值

VALUEUOM

VARCHAR(30)

出量值的单位

STORETIME

TIMESTAMP(0)

存储时间

CGID

BIGINT

护理人员标识符

STOPPED

VARCHAR(30)

是否中断

NEWBOTTLE

INT

是否有准备新溶液

ISERROR

SMALLINT

是否被标记为错误

PROCEDUREEVENTS_MV (医疗过程事件表)

Name

Postgres data type

说明

ROW_ID

INT NOT NULL

-

SUBJECT_ID

INT NOT NULL

-

HADM_ID

INT NOT NULL

-

ICUSTAY_ID

INT

-

STARTTIME

TIMESTAMP(0)

-

ENDTIME

TIMESTAMP(0)

-

ITEMID

INT

-

VALUE

DOUBLE PRECISION

-

VALUEUOM

VARCHAR(30)

-

LOCATION

VARCHAR(30)

-

LOCATIONCATEGORY

VARCHAR(30)

-

STORETIME

TIMESTAMP(0)

-

CGID

INT

-

ORDERID

INT

-

LINKORDERID

INT

-

ORDERCATEGORYNAME

VARCHAR(100)

药物一级分类名称

SECONDARYORDERCATEGORYNAME

VARCHAR(100)

药物二级分类名称

ORDERCATEGORYDESCRIPTION

VARCHAR(50)

药物分类描述

ISOPENBAG

SMALLINT

-

CONTINUEINNEXTDEPT

SMALLINT

-

CANCELREASON

SMALLINT

取消原因

STATUSDESCRIPTION

VARCHAR(30)

状态描述

COMMENTS_EDITEDBY

VARCHAR(30)

COMMENTS_CANCELEDBY

VARCHAR(30)

COMMENTS_DATE

TIMESTAMP(0)

PROCEDURES_ICD(ICD手术记录表)

Name

PostgreSQL data type

Modifiers

说明

ROW_ID

INT

not null

-

SUBJECT_ID

INT

not null

-

HADM_ID

INT

not null

-

SEQ_NUM

INT

操作顺序

ICD9_CODE

VARCHAR(10)

ICD-9 编码

参考文章

  1. 官方文档:https://mimic.mit.edu/about/mimic/
  2. 信息资源管理学报 的一篇文章:
代码语言:javascript
复制
MIMIC-III电子病历数据集及其挖掘研究
陈 静1 李保萍2
(1.华中师范大学信息管理学院,武汉,430079; 2.武汉大学信息管理学院,武汉,430072)
  1. 还有一位大兄弟的博客:https://www.cnblogs.com/linzhenyu/p/13206761.html
本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自作者个人站点/博客。
原始发表:2020/10/29 ,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 作者个人站点/博客 前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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  • 文章目录
  • 1. 概述
  • 2. 字典信息辅助表
    • D_CPT(目前使用医疗服务术语表)
      • D_ICD_DIAGNOSES (ICD病情确诊词典表)
        • D_ICD_PROCEDURES (ICD医疗过程词典表)
          • D_ITEMS(ICU化验词典表)
            • D_LABITEMS(门诊化验词典表)
            • 3. 病人基本信息及转移信息表
              • PATIENTS(病人登记表)
                • ADMISSIONS(住院表)
                  • CALLOUT(出院表)
                    • ICUSTAYS(ICU记录表)
                      • TRANSFERS(病房转移表)
                        • SERVICES(服务表)
                        • 4. 病人医院门诊治疗的相关信息表
                          • CPTEVENTS(当前使用医疗服务记录表)
                            • DIAGNOSES_ICD(诊断信息表)
                              • DRGCODES(诊断相关组编码表)
                                • LABEVENTS(门诊检查记录表)
                                  • MICROBIOLOGYEVENTS(微生物检测记录表)
                                    • PRESCRIPTIONS(处方信息表)
                                    • 5. 病人在ICU里的治疗相关信息表
                                      • CAREGIVERS(医务人员信息表)
                                        • CHARTEVRNTS(化验记录表)
                                          • DATETIMEEVENTS (日期型事件表)
                                            • INPUTEVENTS(注射事件表(CV))
                                              • INPUTEVENTS_MV (注射事件表(MV))
                                                • NOTEEVENTS (文本记录事件表)
                                                  • OUTPUTEVENTS (排泄记录表)
                                                    • PROCEDUREEVENTS_MV (医疗过程事件表)
                                                      • PROCEDURES_ICD(ICD手术记录表)
                                                      • 参考文章
                                                      领券
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