02. R studio/R 工具指南（一：基础篇）

内容及截图部分参见 生信技能树 生信课程。

• Rstudio 的设计结构
  • 帮助
  • 设置
• 创建一个project
• 创建一个脚本
• 代码运行
  • R的命令响应
• 代码保存
• R中的交互
• 相关文件
• 设置编码

什么是R？

R 的下载：https://cran.r-project.org/mirrors.html 你可以在该链接内，寻找指定的镜像。

Rstudio

下载：https://www.rstudio.com/

Rstudio 的设计结构

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帮助

通过 ? 加函数名称，或 help 可以打开R中相关的文件记录帮助文档。类似shell 脚本中的 man 非常好用。

设置

在global option 下可以对studio 相关软件参数进行设置。

比如可以设置外观

创建一个project

可以将project 理解为一个环境，其指定了某些参数，使得相关的脚本可以在该项目中顺利进行；而其他无关的脚本也不会受该project 的相关操作受到影响。

如何验证已经成功打开或者创建了project 了呢？可以通过右上角的标示查看。

另外，该菜单下也可以进行相关的项目相关快捷操作。

创建一个脚本

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代码运行

运行全部代码

或者直接在console 中直接运行。

# 会注释掉代码（不执行）

R的命令响应

R语言非常贴心，对于不完整命令会识别并提示补全命令。

代码保存

会默认保存在工作目录下。一般也就是保存在Rproject 生成的文件夹内。

R中的交互

R 的交互有两种方式：1）console；2）脚本。控制台即写即用；脚本重复利用。

相关文件

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设置编码

在file 菜单下找到 reopen with encoding ，选择utf-8 编码，以防止脚本因编码问题无法识别中文字符。

Rdata

save 可以存储很多个变量。但最终存储的文件需定义 file = "xx.Rdata" 。

一个Rproject 一般包括：

R常见错误

1）文件名不对；路径不对（不在工作目录中）。2）函数所在包没有导入成功；函数拼写。3）包未安装。4）未加载相应Rdata。