21. R 茶话会（二：包函数名冲突问题）
参见：https://mp.weixin.qq.com/s/oxElKitqQjwtD8HkpKk_JQ
虽然说世界上没有两片相同的叶子，但却有几万个张伟，无数个小明。
R 包也一样，有时候明明我需要用的是xx 包的xx 函数，却被R 误当作aa 包的xx 函数。虽然它们都叫做xx 函数，但功能却是大相径庭。
这时候有两种应对的思路。一个是从使用者层面，一个是从开发者层面。
开发者：R告诉你 你错了
我们如何避免这样的问题呢。其实作为R 包的开发者来说，最好还是显式调用：
> tidyr::tibble(mat)
但有的时候，这样做也比较麻烦。要是R 可以帮我们区分，环境中是否发生冲突就好了。即如果环境中有两个函数名相同，就告诉我们要显式调用。
conflicted 便可以解决它：
> library(stats)
> library(tidyverse)
> filter
Error: [conflicted] `filter` found in 2 packages.
Either pick the one you want with `::`
* dplyr::filter
* stats::filter
Or declare a preference with `conflict_prefer()`
* conflict_prefer("filter", "dplyr")
* conflict_prefer("filter", "stats")
Run `rlang::last_error()` to see where the error occurred.
我们可以参照：
将conflicted 包加载在启动配置中。
使用者：你告诉R 他错了
参见：https://mp.weixin.qq.com/s/l90spoS_YQ-6AFcLiqEp0g
虽然我们自己在直接使用函数的时候，用conflicted 是个不错的习惯，并且尽量的使用显式调用。可是在你的环境中不冲突的函数，未必在别人的环境不冲突呀。
而且，有得人开发的R 包使用的函数，很有可能跟你使用的其他函数撞名，直接去修改别人包中函数的源代码，成本就太大了：
> showDatabaseCategory(CellChatDB)
Error: Problem with `summarise()` input `value`.
x could not find function "n"
ℹ Input `value` is `n()`.
ℹ The error occurred in group 1: annotation = "Cell-Cell Contact".
Run `rlang::last_error()` to see where the error occurred.
这时候我们可以先看看环境中哪些包有该撞名的函数：
?summarise
Summarise a data frame.
(in package plyr in library /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library)
Objects exported from other packages
(in package plotly in library /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library)
Summarise each group to fewer rows
(in package dplyr in library /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library)
这个时候加载的顺序也就是函数在环境中的优先级，可见dplyr 所在的位置优先级靠后，因此在使用函数时，R 首先认为是plyr 这个包中的函数。
这个时候直接重新加载一下dplyr 包，优先级就上来了。报错也就轻松解决了。
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原始发表：2021-09-08，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
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