04. Linux 技巧（一：调用文件及其技巧）

调用文件

最直接的方式，便是通过文件的路径，一点一点打出，或者通过相对路径打开文件。

简化调用文件的方式

1）通过赋值。给变量赋值为某个对象

bowtie2=/root/biosofts/bowtie2/bowtie2-2.2.9/bowtie2
$bowtie2 # 调用变量

2）使用alias。类似于快捷方式。

alias bowtie2=/root/biosofts/bowtie2/bowtie2-2.2.9/bowtie2 # 给变量简称
bowtie2 # 调用变量

3）添加环境变量。

export PATH="$PATH:/root/biosofts/bowtie2/bowtie2-2.2.9/" # 需要在 /.bashrc 中添加。

echo 'export PATH=~/.aspera/connect/bin:$PATH' >> ~/.bashrc # 直接echo 写入文件也可以的。

这时候，在任意位置都可以使用bowtie2 啦。但需要注意的是，在环境变量中提过，这种方式在重新连接服务器后会失效。因此我们可以尝试第二种。

这里还提供一种方式。可以修改.bashrc文件。和修改profile 文件一样，在文件的末尾添加指定环境。而至于二者的差异，上文也简单的介绍了。

通过cat 在文件后追加。

cat >> ~/.bashrc
echo 'export PATH=~/xxx/xxx/bin:$PATH'

接着通过ctrl+c 退出。

不过需要注意的是，这里使用时需要小心，一旦写成了 cat > 就不再是文件末尾追加，而是覆盖重写文件了。因此，建议在避免/小心该操作的同时，可以备份一个bashrc 文件。

1. 通过ln 创建符号连接。

ln -s x1 x2

将x1 下文件 与x2 下文件建立软连接。

如果我们将x2 的目录添加到环境变量中，以后便可以直接通过访问该链接来调用原x1 软件。比如我通常习惯创建一个bin 文件夹，将其放到环境变量里。