互联网游荡指北（第一期）

这里记录一段时间我在互联网上看到的有意思的内容与信息，防止它们在我的脑袋里走丢了。

灵感来自于阮一峰的网络杂志。

本杂志开源（GitHub: mugpeng/second_brain[1]），欢迎提交issues，上传你的所见所闻。亦或对这样的网络杂志提供建议😊。

一、编程与工具

可视化

1、R 中绘制PPI 网络图[3]

当要绘制网络图时，我第一个想到的是cytoscape，现在使用R包igraph 也可以解决类似的需求了。

此外生信星球也写过文章，个人觉得相对来说下面这个版本的图更好看一些：

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此外，还有networkD3 和ggraph 这两个包[4]，可以实现比较丰富的网络绘图。

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2、使用ggpattern 包填充颜色

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甚至还可以把照片加进去：

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3、使用vennpie 绘制韦恩图饼版

主要还是使用R 包VennDetail中的vennpie 方法，可以比较直观的显示各部分的比例差异。

但我觉得这种图还是存在一定的缺点，比如乍一看很难发现各层所代表的内容（按照顺序A-E）。这里我觉得可以采用外围边框color 和内圈填充fill 两种颜色区分。

当然也可以采用上述ggpattern 包，通过填充进行修改。

你可以对比一下基础的韦恩图比较一下：

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4、Leaflet 包绘制交互式的地图[5]

显而易见，比maptools 绘制内容要好看很多。

下面的庄闪闪的R语言手册例子，提供了更细致的介绍：Leaflet 与高德合并会擦出怎么样的火花？

并且，作者也提到了一个地图主权的关键问题：

因为本教程为了适用性使用的是高德的底图（GCJ02坐标系），如果您是WGS84坐标系在后续代码中删除高德的底图就好（一定会面临主权问题）；如果您是 BD-09 坐标系，这个需要转换且比较复杂。

工具

5、使用在线vscode 进行代码或文本创作[6]

你首先要做的是在github 中创建一个专门的仓库，接下来通过以下代码：

https://github.dev/[用户名]/[仓库名]

在世界任何地方在线编辑你的内容了。

6、在免费服务器上部署一台远程vscode 编辑环境[7]

相比上面一条，相当于把内容从github 上部署到自己的服务器上。

极客很多，也麻烦不少。

7、可以在GitHub.dev 上完成的十件有意思的事情[8]

这里我主要尝试了其中一种：在github dev 中运行python 代码。因为默认下其并不提供一个开发环境，因此我们并不能在上面直接运行编辑的代码。

通过vs code 拓展vscode-pyodide[9]，并创建ipynb 文件，我们可以实现了Jupyter 笔记本风格的python 代码运行：

但我也发现了一个小bug，就是底下的输出结果只可以显示一行：

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二、科技与生活

8、将你的NFT照片放在虚拟画廊里[10]

简单尝试了一下，绑定虚拟货币钱包后，就可以在画室中上传自己的NFT 画作了：

你可以在 Opensea[11]中免费上传自己的画作。

我觉得这是一个很有意思的尝试。

随着XR 设备的普及，未来我们可以佩戴虚拟现实设备，参见这些虚拟的画展。通过NFT 加密，可以确保这些艺术品的真实性。

三、学习资源

课程与教程

9、R 数据科学学习教程及50个ggplot 可视化案例[18]

非常细致的可视化教程了：

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10、如何来系统地学习统计学？- lrhao的回答 - 知乎[19]

11、Samantha Ming 个人网站[20]

来自阮一峰的推荐，她在个人网站上分享了很多前端代码的技巧，内容质量很高，制作精美。

12、程序员的数学导论[21]

书籍是在线且开源的，做的非常用心。

四、新闻与前沿

13、中国科学家实现二氧化碳合成淀粉[22]

参考资料

[1]mugpeng/second_brain: https://github.com/mugpeng/second_brain

[3]R 中绘制PPI 网络图: https://zhuanlan.zhihu.com/p/163498417

[4]networkD3 和ggraph 这两个包: https://www.jianshu.com/p/a1a83341e9e5

[5]Leaflet 包绘制交互式的地图: https://blog.csdn.net/allenlu2008/article/details/52816708

[6]使用在线vscode 进行代码或文本创作: https://github.dev/

[7]在免费服务器上部署一台远程vscode 编辑环境: https://justyy.com/archives/45744

[8]可以在GitHub.dev 上完成的十件有意思的事情: https://juejin.cn/post/7004738629092261895

[9]vscode-pyodide: https://marketplace.visualstudio.com/items?itemName=joyceerhl.vscode-pyodide

[10]将你的NFT照片放在虚拟画廊里: https://oncyber.io/

[11]Opensea: https://opensea.io/account

[18]R 数据科学学习教程及50个ggplot 可视化案例: http://r-statistics.co/Top50-Ggplot2-Visualizations-MasterList-R-Code.html#Time%20Series%20Plot%20From%20a%20Time%20Series%20Object

[19]如何来系统地学习统计学？- lrhao的回答 - 知乎: https://www.zhihu.com/question/22491085/answer/1914692165

[20]Samantha Ming 个人网站: https://www.samanthaming.com/

[21]程序员的数学导论: https://pimbook.org/

[22]中国科学家实现二氧化碳合成淀粉: https://zhuanlan.zhihu.com/p/413503450