互联网游荡杂志（第四期）

这里记录一段时间我在互联网上看到的有意思的内容与信息，防止它们在我的脑袋里走丢了。

灵感来自于阮一峰的网络日志：科技爱好者周刊[1]。

本杂志开源（GitHub: mugpeng/second_brain[2]），欢迎提交issues[3]，上传你的所见所闻。亦或对这样的网络杂志提供建议😊。

因为内容比较多的缘故，建议你通过使用sourcegraph[4] 搜索杂志中感兴趣的内容。

会思考的乌鸦

你是否曾经问过自己，“我现在就读的专业，我现在从事的工作，真的是我喜欢的吗？真的是我愿意奉献青春，奉献芳华吗？”

到底是我选择了生活，还是生活选择了我呢？

一、编程与工具

可视化

1、果壳团队可视化作品[9]

. 都是非常有脑洞的作品。非常有意思。摸鱼绝配哦！

2、R可视乎｜创建乐高版马赛克图

用R 做乐高积木图：

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画个心爱的小白马，送给心爱的那个她，岂不是美哉。

工具

3、十行笔记：上传视频自动生成笔记[10]

记得先前还参与过整理会议视频文稿的工作，要是当初知道这个工具，会方便非常多啊：

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4、像编辑文本一样，编辑视频：descript[11]

类似十行笔记，该工具能将视频和音频中的内容识别转换为文字。但除此之外，作为一款剪辑软件，你在编辑文字的同时，视频和音频的对应内容也同步进行剪辑，非常的方便。相比在Pr中一帧帧扣，会方便非常多。

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5、微信内置：微信指数

可以在搜一搜中直接搜索：

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进入后可以看到更详细的图表信息：

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6、使用latex模板构建个人履历

latex是一种基于ΤΕΧ的排版系统，不仅在论文中可以用它来进行排版书写，用来做笔记也是不错的。

本文基于Overleaf 网站进行cv 创建。

7、踩坑日志 | kingfisher 公共测序数据 SRA/Fastq 下载神器！

算是整合了几个常用公共测序数据的下载工具和下载源，比如ascp, perfetch 等，非常实用。

生信

几个生信pipeline 创建软件：8、用Snakemake跑pipeline

9、ilus: 这是我写的一个轻量级全基因组（WGS）和全外显子（WES）最佳实践分析流程生成器

10、workflow manager[12]

11、一文看全！史上以来的72家测序仪公司

本文从测序的历史谈到测序行业的主力公司，内容非常充实。

统计学

12、一张统计学神图

这张图主要还是看数据的差异。

二、科技与生活

13、海外抗癌新药大盘点——其他癌种篇

14、没体验过这个 别说你懂VR[13]

facebook的quest2 真的是一款无论是设备、价格、生态都吸引我的VR 设备了：

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三、学习资源

15、ggplot2 可视化进阶[14]

这么丝滑的高亮分图，已足够打动我的心。

16、线上学术报告，狗熊会主办及转载[15]

里面有非常多的线上学习报告。

. 我收听了其中统计之都创始人，也是R studio 早期员工的谢益辉的演说[16]，挺有意思。而且大佬真的非常的谦虚。

其中比较让我触动的是他的工作与学习的方式，个人总结下来就是：不断在做/学习自己用得上的东西，不断地方便自己，顺便也成就了自己。

其次，“人生无难事，只要肯放弃”。

17、现代统计图形[17]

很有意思的一本统计与R相关的科普书。可以作为R 入门时候的睡前读物（我就是摸鱼读完的~）。

里面有很多关于统计的历史，且有非常多少见的、或者让人眼前一亮、脑洞大开的可视化方式。

四、新闻与前沿

28、国际顶刊PNAS发文：“同质化”论文暴增，从根本上阻碍了科学的进步！

作者反应了科研界的“马太效应” 现状：在大多数学科中，引用最多的论文获得了更高的引用份额。

大量论文的发表不但没有加快研究范式的更替，反而巩固了经典研究。

作者提出了自己的建议：

• 构建更清晰的期刊等级体系，通过最具影响力的出版机构，引导科研人员从常规工作转向学术创新。
• 调整科研机构和企业的奖励和晋升制度，避免数量的权衡，提升质量、创新性贡献等指标的重要性。
• 在研究生培养、科研能力评估、科研经费申请方面制定新的考核标准，激励科研人员摆脱既定教条，提出新奇的idea。

参考资料

[1]阮一峰的网络日志：科技爱好者周刊: https://github.com/ruanyf/weekly

[2]mugpeng/second_brain: https://github.com/mugpeng/second_brain

[3]issues: https://github.com/mugpeng/second_brain/issues

[4]sourcegraph: https://sourcegraph.com/github.com/mugpeng/second_brain

[9]果壳团队可视化作品: https://datamuse.guokr.com/home

[10]十行笔记：上传视频自动生成笔记: https://videoai.perspectivar.com/

[11]像编辑文本一样，编辑视频：descript: https://www.descript.com/

[12]workflow manager: https://www.nature.com/articles/s41592-021-01254-9.epdf?sharing_token=PVE8zdv0ymug_6OM4_QgKNRgN0jAjWel9jnR3ZoTv0OsA3GwSLYb6fNLyGpuUMTaYvo9Wdf90KP2BE13GkdM7BlFsIy03fWrZixiMpUSRJoIU1kqWIrPWKqMeI_kRIqWJMXbKlin7ZVPx4oXRGuohgq3SXFo76LILVPqk3Z1n3E%3D

[13]没体验过这个 别说你懂VR: https://www.bilibili.com/video/BV15M4y1G7fJ?share_source=copy_web

[14]ggplot2 可视化进阶: https://www.cedricscherer.com/2019/08/05/a-ggplot2-tutorial-for-beautiful-plotting-in-r/#prep

[15]线上学术报告，狗熊会主办及转载: https://www.xiong99.com.cn/middle/v_5fd3614fe4b04db7c0945eb7/3?content_app_id=

[16]谢益辉的演说: https://www.xiong99.com.cn/detail/v_5fd3614fe4b04db7c0945eb7/3?fromH5=true

[17]https://bookdown.org/xiangyun/msg/: 现代统计图形