互联网游荡杂志-第七期-超全面肿瘤相关数据库

这里记录一段时间我在互联网上看到的有意思的内容与信息，防止它们在我的脑袋里走丢了。

灵感来自于阮一峰的网络日志：科技爱好者周刊[1]。

本杂志开源（GitHub: mugpeng/second_brain[2]），欢迎提交issues[3]，上传你的所见所闻。亦或对这样的网络杂志提供建议😊。

因为内容比较多的缘故，建议你通过使用sourcegraph[4] 搜索杂志中感兴趣的内容。我写了一篇其用法的简明笔记：好物分享第12弹-用三款软件实现“内容检索自由”

封面图

我在一家书店拍到的内容。

所以说，我们为什么会这么容易把雨伞架当成垃圾桶呢？

由图可见，垃圾桶就在雨伞架的旁边。

我的一个想法是，将雨伞架放在与垃圾桶较远的位置。并且在雨伞架中挂1、2把雨伞，效果会不会好一些？

生活中也是一样，相比起告诉你要做什么，引导你做什么，效果会不会更好呢？

会思考的乌鸦

ps：这里想尝试一下flomo 的分享功能。

关于mise en place 的一些介绍。

我们用卡片笔记来学习创作，道理是否也是相同的呢？平时把卡片都准备好了，有了大致的概念，和附着在每张卡片的记忆，等到需要用到它们的时候，就可以像大厨一样，游刃有余了。

一、编程与工具

1、Wayback Machine – 带你穿越互联网，找回消失的网页 - 梦想天空（山边小溪） - 博客园 (cnblogs.com)[5]

最近他们出了一个未来网站专题，很有意思：Internet Archive's 25th Anniversary • Imagine the future of the Internet[6]

2、GitBook | 手把手教你搭建 免费博客 / 网络文档 / 多人协作编辑~ (qq.com)

GitBook是一款支持Markdown写作的文档平台，似乎初衷是面向程序员写软件手册的。由于其完美支持Markdown，并且能够像使用GitHub进行托管搭建个人blog一样，使文档直接挂到网上，因此用来写写分析记录、分享心情随笔、甚至写电子书等都是非常不错的选择。

一般对于写文档来说，GitBook的免费功能已经够用，但是付费的GitBook更强大，付费之后能够使用团队协作功能，支持多人共同开发一个文档，并且能够查看文档的每个修改记录，并选择是否接受修改。以及一些其他开发功能，例如自定义主题颜色、字体、直接将文档导出为PDF等功能。

3、Notion-faster (jerryw.cn)[7]

用优质线路对Notion进行反向代理, 以加速Notion在中国大陆的访问速度, 解决Notion打不开、网速慢等问题。目前的权宜之计, Notion在中国大陆网络环境得到极大改善之时，就是此项目结束之日。

4、录屏好帮手，实时显示按键操作的小工具：KeyCastr - 知乎 (zhihu.com)[8]

俗话说，一图胜千言。无论你是在为教程配图，还是上台做演示，比起絮絮叨叨的一大段描述，总是图片/视频更为直观。而为你的演示配上「字幕」，可以让它更加清晰明了。

KeyCastr 就是一款实时显示按键操作的工具，能让读者或观众一眼就明白当前的操作。

二、生信

5、【收藏版】常用肿瘤相关数据库（非常详细，非常全面） - 知乎 (zhihu.com)[9]

作者总结了超级多的数据库及其简单介绍：

6、诺奖级表型数据库！申请国自然，你一定不能错过这个数据库！(qq.com)

Human Autophagy Database数据库网址为（http://www.autophagy.lu/index.html），数据库简称HADb，提供直接或间接调解自噬过程的人类基因/蛋白质信息，基因信息部分提供GBrowse或Ensembl链接，蛋白质信息有蛋白家族、转录后修饰、相互作用、蛋白结构及功能、细胞定位、同工型等），subsection clustering部分提供自噬相关蛋白基序、位点和结构域信息。

7、数说风云 | 经济学诺奖，花落因果家 (qq.com)

因果推断这一问题分为三个层次。

• 第一个层次是相关分析。若两个变量之间相关，其未必有因果关系。因为它们可能受同一个变量即混杂因素的影响。
• 第二个层次是因果作用。若要正确评价因果作用，则需要观测到所有的混杂因素。而当研究问题中含未观测混杂因素时，这两位今年的诺贝尔经济学奖获得者及其同事提出的工具变量方法被用来消除未观测混杂因素的影响，以正确评价因果作用。
• 第三个层次是反事实推断，这是因果推断的最高层级，它强调人们对已经采取的处理和发生结果的反思及改进。例如，一位有10年烟龄的病人得了肺癌，我们要关心其肺癌由吸烟导致的概率有多大。要反思的问题是：假如该病人不吸烟是否还患肺癌？ 这类反事实问题在某些需要归因的场景下十分常见，如法律判决、疾病诊断、机械故障判断、药物副作用判别等。

三、设计与可视化

8、Web Design Museum 1991 – 2006[10]

非常多有意思的古早网站案例：

9、Wallet - Apple[11]

这个过场真是太丝滑了：

10、绘制哑铃图从未如此简单 (qq.com)

个人觉得哑铃图是用于替代柱状图的不错选择：

四、科技与生活

11、人体有哪些奇怪的开关？(qq.com)

12、《自然》重磅：这种饮食方式可以限制肿瘤生长！你真的吃对了吗？(qq.com)

在新研究中，Heiden教授和同事一共在肿瘤小鼠模型中设置了三个组别：正常饮食、生酮饮食和热量限制。初步结果显示，只有热量限制组的小鼠肿瘤生长会明显放缓。

五、学习资源

13、单细胞天地2019文献速递合辑 (qq.com)

14、单细胞天地2020文献速递合辑 (qq.com)

15、单细胞天地2021文献速递合辑 (qq.com)

这么多单细胞文献合集，应该够你读了吧~

参考资料

[1]阮一峰的网络日志：科技爱好者周刊: https://github.com/ruanyf/weekly

[2]mugpeng/second_brain: https://github.com/mugpeng/second_brain

[3]issues: https://github.com/mugpeng/second_brain/issues

[4]sourcegraph: https://sourcegraph.com/github.com/mugpeng/second_brain

[5]Wayback Machine – 带你穿越互联网，找回消失的网页 - 梦想天空（山边小溪） - 博客园 (cnblogs.com): https://www.cnblogs.com/lhb25/archive/2013/05/05/internet-page-history.html

[6]Internet Archive's 25th Anniversary • Imagine the future of the Internet: https://wayforward.archive.org/ia2046/

[7]Notion-faster (jerryw.cn): https://jerryw.cn/notion-faster

[8]录屏好帮手，实时显示按键操作的小工具：KeyCastr - 知乎 (zhihu.com): https://zhuanlan.zhihu.com/p/29982257

[9]【收藏版】常用肿瘤相关数据库（非常详细，非常全面） - 知乎 (zhihu.com): https://zhuanlan.zhihu.com/p/268429566?utm_source=wechat_session&utm_medium=social&utm_oi=766062012026331136&utm_campaign=shareopn&s_r=0

[10]Web Design Museum 1991 – 2006: https://www.webdesignmuseum.org/

[11]Wallet - Apple: https://www.apple.com/wallet/