MeSH: NCBI主题词数据库

之前介绍 [[PubMed-使用指南]] 的时候提到了。PubMed 的检索系统是基于 ATM 系统来检索的。而 ATM 系统主要是把关键词映射到 MeSH 数据库。所以今天就介绍一下关于 MESH 主题词数据库 MeSH : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh

主题词

医学主题词 (Medical Subject Headings) 说白了就是医学方面的专业性词汇。比如 mutation (突变), methylation (甲基化) 等等。

这些主题词的主要用途主要是有两个方面

了解专业性的表述: 在了解一个新的领域的时候总有一些新的词汇。比如你的老板和你说查一查 可变剪切相关的内容。这里就涉及到中英文转换的问题。如果是按照直翻的话，那可变剪切就是"Variable shear"。但是在医学专业性词汇当中则是"Alternative Splicings"。

基于主题词检索文献: 某一个研究方向往往有多种表述方式。如果只是检索其中一个的话有可能就会遗漏其他一些相关的研究。所以基于主题词检索就可以把这些表述方式都包括进去了。

Mesh 数据库

MeSH 是按照层级结果来储存主题词的。首先 MeSH 主要分成了 19 个大类。

在每个大类下面，都会有具体的其他的小类。比如疾病分类当中：就包括多个物种疾病的名称。

除了一层一层的查看。还可以直接检索想要查询的名次。比如："breast cancer"。

通过检索发现乳腺癌的主题词是"Breast Neoplasms"。点击具体的主题词就可以看到更加详细的信息。首先可以看到经常和乳腺癌搭配的一些其他主题词。

如果有想要了解某一个方面的主题词的话，可以直接选择，然后就可以在旁边构建检索式进行检索。例如，乳腺癌分型有关。

再往下就可以看到和这个主题词相关的一些表述。

最后也可以看到乳腺癌这个主题词的具体层级结构。

MeSH 的应用

以上就是关于 MeSH 的使用了。这里就简单的介绍一两个 MeSH 的使用方法。

pubmed 检索

在 pubmed 当中通过主题词检索可以找到更准确更全面的文献。在 pubmed 当中有一个"MeSH Terms"的检索选项。

通过这里的检索和在所有区域检索结果还是不一样的。例如都是检索"breast neoplasms"。主题词检索就更加准确一些。

快速了解某一个检索结果的内容

在之前介绍的 [[PubTator-pubmed检索注释高亮]] 当中，我们提到的对于检索结果的高亮可以让我们快速的了解这个文字当中有哪些相关的疾病/基因等等。而这些内容的注释就是基于主题词来进行注释的。