好物分享22-科研巡礼04-利用zotero批量抓取文献

前言

其实我自己是没有特别多的抓取文献的需求的。最近正好在捯饬[[22-用researchrabbit联动zotero打造文献一条龙]]，就来复习一下。

1-批量抓取某作者的全部文献

这里可以参考重磅｜Zotero如何一次抓取某个作者发表的全部论文，并显示引用量？- 知乎 (zhihu.com)[1]

利用zotero 浏览器插件加谷歌学术：

实现一键保存到zotero：

2-从外部获取

这里你，可以从外部获取，比如其他人的zotero 文献集，或endnote 等软件的文献集，亦或是自己的搜索结果。

在[[18-科研第一课：学会搜索]] 中，我也提到过，pubmed 是一款不错的生物医学领域的搜索工具，这里以此为例子。

2.1-获得某篇文献的全部引文或被引

比如以这篇文章为例：Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial - PubMed (nih.gov)[2]

这里的话，发现pubmed 仅仅有被引用的接口：

我们打开这个页面，就可以进行下载类型的选择了，你可以对其被引文章进行一定的筛选，这里我仅仅是简单的获取了当前页面的内容，接下来会保存成一个 nbibpubmed-34983369pm-set.nbib 格式的文件：

我们可以直接将该文件导入进zotero 中：

这时候我们可以对这个文件夹进行个性化的处理了，因为我设置默认不抓取文献，你可以设置为默认，或者像我一样，批量对那些感兴趣的文献进行下载查看：

接下来，你就可以利用如research rabbit 这种文献分析工具了。

关于如web of science 等其他数据库使用，可以参考：如何快速下载一篇经典文章的所有参考文献?【技能GET√】 - 知乎 (zhihu.com)[3]

这里我还想多说一句，上面提到pubmed 我仅仅找到了被引的批量查看接口，而没有引文的，这里的话，我尝试使用和pubmed 共通的数据库pmc 来获取引文Current best practices in single‐cell RNA‐seq analysis: a tutorial (nih.gov)[4]，发现同样没有接口。

好家伙，看来我只能转头web of science ，亦或是research rabbit 这种超级好用的工具：

下期给你们叨一叨。

2.2-获得某个搜索

其实更加简单了，这里我喜欢用 web of science ：

可以非常无脑的帮我筛选高被引文献，直接导出即可。

导入zotero 的步骤，同样如上所述。

参考资料

[1]重磅｜Zotero如何一次抓取某个作者发表的全部论文，并显示引用量？- 知乎 (zhihu.com): https://zhuanlan.zhihu.com/p/110121319

[2]Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial - PubMed (nih.gov): https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31217225/

[3]如何快速下载一篇经典文章的所有参考文献?【技能GET√】 - 知乎 (zhihu.com): https://zhuanlan.zhihu.com/p/53863534

[4]Current best practices in single‐cell RNA‐seq analysis: a tutorial (nih.gov): https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6582955/