第一次接触蛋白质结构预测,记录一下笔记。
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Drug targets是蛋白质
蛋白质是大型生物分子,由很多的氨基酸amino acids组成
蛋白质结构的要素有螺旋(helic),折叠sheet和无规则卷曲loop
可以把蛋白质想象成一个大型的球状结构,上面有很多的凹槽(grooves)什么是结合部位(Binding Site)?
[它们可能有一个埋藏的结合位点,这有利于药物的可药用性,可以找到或设计一个小的药物分子来填充这个结合位点.药物比蛋白质小。配体越适合蛋白质结合位点,药物的效力就越强。我们经常谈论“锁中的钥匙”图像来解释配体-蛋白质结合]
当我们考虑药物和蛋白质的相互作用的时候,我们其实在考虑分子层面的相互作用
下面是视频的翻译,看视频会好理解一些。