导语
GUIDE ╲
肺癌是人类肿瘤的头号杀手。虽然近年来靶向治疗和免疫治疗取得了突破性进展,但患者仍会出现耐药、免疫治疗无效等情况。在单细胞水平上研究可以精确了解患者体内、以及患者间的异质性,提高细胞差异性研究的分辨率,帮助更好指导治疗。
背景介绍
肿瘤周围的组织、免疫细胞、血管和细胞外基质共同组成了极其复杂的细胞生态系统,统称为肿瘤的微环境。而单细胞测序可以从单细胞精度上,了解基质细胞的异质性、以及基质细胞和肿瘤细胞是如何相互影响、互相博弈的。
今天小编为大家梳理一篇于2018年8月发表于Nature Medicine (IF:32.621)的文章,一起来看看肺癌微环境中的基质细胞突图谱。
数据介绍
入组5例未经治疗的NSCLC患者,其中2例腺癌,2例鳞癌,1例大细胞癌。采集每例患者的3份肿瘤组织样本、以及1份同一肺叶下远端正常肺组织样本,进行单细胞测序。
入组3例未经治疗的NSCLC患者作为验证集。
TCGA数据库以及其它研究中的1572名NSCLC RNA-Seq数据及预后信息 (1027 LUAD 和 545 LUSC)。
结果解析
01
NSCLC细胞亚群聚类及注释
02
TME中的内皮细胞簇
03
TME中的成纤维细胞簇
04
TME中的B细胞簇
05
TME中的巨噬细胞簇
06
TME中的T细胞簇
07
TME中的肺泡(上皮)细胞簇
08
基质细胞亚型与缺氧关联
09
基质细胞亚型关联临床信息
小编总结
一张导图带您回顾文章的思路: