非root用户，如何借助Anaconda，来安装R语言和R包

作图丫

发布于 2022-03-29 14:31:15

2.8K00

代码可运行

文章被收录于专栏：作图丫作图丫

运行总次数：0

代码可运行

导语

GUIDE ╲

非root用户如何在conda环境下，实现安装自由？

-------以R语言和R包为例。

背景介绍

之前我们介绍过：非root用户，如何在集群上安装Anaconda的方法，后台的很多小伙伴已经反馈顺利安装。那么今天，小编继续为大家带来进阶版：非root用户，如何借助Anaconda，来安装R语言和R包。

安装步骤

01

Step1.配置conda,添加一些源

conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels defaults
conda config --add channels r
conda config --add channels bioconda

02

Step2.安装特定版本的R语言

以R version为3.6.3为例：

onda info --envs # 查看环境
conda create -n r #创建名为r的独立运行的环境，这样不会由于不同程序的依赖关系而导致冲突；
source activate r #进入并激活名为r的环境
conda list   #查看当前安装的软件
conda install r-base=3.6.3  #安装R 指定为R版本为3.6.3
conda deactivate # 退出当前环境
conda remove --name r --all #移除r环境

03

Step3.安装R包

Conda安装R包有两种方式（以ggplot2为例）：

第一种方式是使用conda命令安装：

source activate r 
conda install -c r-ggplot2 #R包通常需要以r-开头，以ggplot2为例。需要注意的是conda下面的r包的名称与普通R包的名称不一样，具体名称可以在官网上面查询（http://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/）

第二种方式是直接从conda进入到R的交互界面，利用bioconductor或install.packages命令：

#用bioconductor的方式：
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("ggplot2")
#用install.packages命令：
install.packages(ggplot2)

小编总结

非Root权限下，在Anaconda环境中安装R和R包，你学会了吗？还有什么想学习的可以在后台联系小编，给大家安排~！

本文参与腾讯云自媒体同步曝光计划，分享自微信公众号。

原始发表：2021-01-25，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

r 语言