题目 :Diverse human astrocyte and microglial transcriptional responses to Alzheimer’s pathology 期刊:Acta Neuropathologica (2022) 143:75–91 日期:2021年11月 DOI:https://doi.org/10.1007/s00401-021-02372-6
文章分析思路
24+24=48个snRNAseq,这篇文章应该花了很多钱。
文章提到是使用MAST包的zlm()进行的回归分析。
MEGENA--module
SCENIC--regulon
这篇单细胞文章测序样本量大,且有创新之处,即富集的Astro与Micro。而且计算差异基因方式很有新意,即进行病理指标的回归,也许更可以反映出基因表达水平与AD病理特征的关系。文章也使用多种多样的单细胞数据分析手段,例如亚群分析、细胞通讯分析、转录因子分析。总之无论是测序数据还是分析方法,都挺有借鉴价值的。