菲沙医学单细胞多组学线上培训班重磅开启（空间单细胞转录组加上单细胞免疫组库）

生信技能树

发布于 2022-06-27 21:09:29

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发布于 2022-06-27 21:09:29

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四年前我们的全国巡讲广州站的学员找到了我，说希望可以系统性出一个单细胞多组学线上培训视频课程，尤其是空间单细胞转录组加上单细胞免疫组库：

四年前我们的全国巡讲广州站的学员找到了我

确实，我们虽然有一个专注于单细胞数据处理技术分享的公众号：《单细胞天地》，但确实是一直专注于常规的单细胞转录组数据分析，无非是降维聚类分群，以及不同分组看细胞亚群比例差异或者表达量差异。上游就是我们多次分享过cellranger流程的笔记，大家可以自行前往学习，如下：

差不多几个小时就可以完成全部的样品的cellranger的定量流程，我们也反反复复在多个公共数据集里面演练了。参考：

至于拿到单细胞表达量矩阵后的走seurat流程进行单细胞降维聚类分群，这样的基础分析，有基础10讲：

理论上大家应该是在普通单细胞转录组数据处理方面没有问题了，所以才会找我要单细胞多组学教程，比如（空间单细胞转录组加上单细胞免疫组库）

为什么不弄单细胞多组学线上培训视频课程

首要原因是我们的商业定位，专注于生物信息学基础打磨，就是计算机基础知识，分成基于R语言的统计可视化，以及基于Linux的NGS数据处理：

针对这个生物信息学基础，我们有马拉松课程。强烈建议你推荐给身边的博士后以及年轻生物学PI，多一点数据认知，让他们的科研上一个台阶：

数据挖掘（GEO,TCGA,单细胞）2022年5~6月场，快速了解一些生物信息学应用图表
生信入门课-2022年5~6月场，你的生物信息学第一课

这个马拉松课程我可以负责任的广而告之，因为授课内容设置，讲师和助教们培养，都是我一手带起来的，教学质量杠杠的。

而且但凡是打磨好基础其实后续任何多组学技术，都是可以自行看文档解决。比如自学空间单细胞转录组就是可以看：《Spatial deconvolution of HER2-positive breast cancer delineates tumor-associated cell type interactions》：