安装退出历史舞台的R包

安排新来的实习生整理最简单的GEO数据库的表达量芯片数据处理代码，有一个拼图的需求，不知道为什么实习生找到了一个customLayout包，但是无法安装和使用它，所以求助了我。

我看了看，直接安装customLayout确实会报错：

报错

简单的搜索一下customLayout的官网 ：

customLayout的官网

可以看到每个包都可以通过这样的URL查询：

• https://cran.r-project.org/package=customLayout

会根据包的情况自动跳转，这个包就进入了：https://cran.r-project.org/web/packages/customLayout/index.html

很明显，它这个customLayout其实是被放弃了 ：

Package ‘customLayout’ was removed from the CRAN repository.

Formerly available versions can be obtained from the archive.

Archived on 2021-01-24 as check problems were not corrected in time.

所以只能是看历史版本：https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/customLayout/

可以看到有多个时间线的版本：

customLayout_0.1.0.tar.gz 2018-09-12 17:10 130K  
customLayout_0.2.0.tar.gz 2018-09-27 16:20 953K  
customLayout_0.3.0.tar.gz 2018-10-31 08:20 1.3M  
customLayout_0.3.1.tar.gz 2020-01-17 13:20 1.3M  
customLayout_0.3.2.tar.gz 2021-01-14 16:20 1.3M  

很简单的安装这个 退出历史舞台的R包 ：

packageurl <-  'https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/customLayout/customLayout_0.3.2.tar.gz'
install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")

大概率是缺这个退出历史舞台的R包的相关依赖包，比如我电脑就缺了一个，需要先单独安装它依赖的包即可 ：

单独安装

是不是很简单啊！

需要基本生信背景知识

当然需要读者具备计算机基础知识，我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化，以及基于Linux的NGS数据处理：

• 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》
• 《生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)》

其中，R语言可能更重要一点，我把R的知识点路线图搞定，如下：

• 了解常量和变量概念
• 加减乘除等运算（计算器）
• 多种数据类型（数值，字符，逻辑，因子）
• 多种数据结构（向量，矩阵，数组，数据框，列表）
• 文件读取和写出
• 简单统计可视化
• 无限量函数学习