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CIRCexplorer2

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可能性之兽
发布2022-08-17 03:28:04
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发布2022-08-17 03:28:04
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文章被收录于专栏:生信漫游者

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CIRCexplorer2是一个全面和综合的环状RNA分析工具集。它是CIRCxplorer的继任者,具有许多新功能,可促进环状RNA鉴定和表征

特征

  • 精确注释循环RNA(注释)
  • 支持多个圆形RNA矫正器(TopHat2/TopHat-FusionSTARMapSpliceBWAsegemehl)(对齐解析))
  • 从头开始组装新的环状RNA转录本(组装)
  • 表征环状RNA(Denovo)的各种替代(反向)剪接事件)
  • 使用STARBWA快速识别环状RNA(解析)
  • 支持单读取和配对端排序。

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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