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本地安装TwoSampleMR包!!!

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生信与临床
发布2022-08-21 16:53:57
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发布2022-08-21 16:53:57
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这几天米老鼠频繁收到小伙伴关于安装不上TwoSampleMR包的问题,我后来查看了一下,应该是网络连接的问题。我后来尝试下载TwoSampleMR包后本地安装,成功解决。

接下来,米老鼠和大家分享手动安装TwoSampleMR的方法:

第一步

进入Github官网,搜索TwoSampleMR,点击第一个结果进入如下页面(https://github.com/MRCIEU/TwoSampleMR),点击绿色的Code按钮,选择并点击Download ZIP,然后慢慢等待该压缩包下载好:

接下来,继续用同样的方法下载MR-PRESSO包(https://github.com/rondolab/MR-PRESSO),如下图所示:

虽然大家也可以在MRCIEU仓库里下载MRInstruments包,但由于下载速度过慢常常会失败,这里米老鼠把这个包导入到自己的Gitee里(https://gitee.com/mickey-mouse/MRInstruments),大家可以点击黄色按钮,选择“下载ZIP“,如下图所示:

第二步

移动下载好的压缩包到工作目录并修改压缩包的名称。这里需要把下载好的压缩文件移动到你的工作目录,米老鼠喜欢移动到文档底下,然后依次将TwoSampleMR-master改为TwoSampleMR, 将MR-PRESSO-master改为MRPRESSO, 以及将mickey-mouse-MRInstruments-master改为MRInstruments。

修改前:

修改后:

第三步

手动安装R包,这里R包的安装顺序很重要。安装前必须要先安装好devtools这个包

1. 首先安装MRinstruments包:

代码语言:javascript
复制
devtools::install_local('./MRInstruments.zip')

2. 接下来安装MRPRESSO包:

代码语言:javascript
复制
devtools::install_local('./MRPRESSO.zip')

3. 最后,安装TwoSampleMR包:

代码语言:javascript
复制
devtools::install_local('./TwoSampleMR.zip')

4. 安装完毕后加载TwoSampleMR包:

代码语言:javascript
复制
library(TwoSampleMR)

结果如下图所示,说明安装成功:

安装时千万别更新其他包!!!

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2020-12-12,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 生信与临床 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

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