关于MR-Egger方法的注意事项（二）

严格来说，这篇推送主要讲的不是MR-Egger方法，而是帮大家整体理解一下如何恰当选择MR的三大传统计算方法，它们包括IVW，MR-Egger和Weighted Median。

IVW是最早使用的方法，也是最常用的，它需要SNP完全符合MR研究三原则才能得到正确的因果估计；MR-Egger多加了截距项，其主要目的是判断水平多效性的有无；Weighted Median是利用大部分SNP（majority of genetic variants）来判断因果关系的有无。

接下来是重点部分：

首先推荐使用“MR-PRESSO”包（后面我会简单介绍它的使用情况）来检测outliers是否存在，一旦存在，剔除outliers，然后进行下面的分析。当然，大家也可以使用leave-one-out sensitivity analysis的方法剔除outliers，但我个人更倾向于”MR-PRESSO“方法。

MR方法选择三大原则：

（1）在没有异质性和多效性的情况下，优先使用IVW的估计结果；

（2）只有异质性，没有多效性时，优先使用Weighted Median方法的结果（也可以使用IVW的随机效应模型）；

（3）有多效性时，优先使用MR-Egger方法计算出的结果。

最后提醒一下，SNP数目多的时候统计效力足，但是异质性和多效性可能会比较大，如果去除部分SNP后，可以消除异质性和多效性，但是会导致统计效力低，使结果变成阴性。因此，大家需要好好斟酌一下选择何种方法！

无论数据怎么变，真理永远都在那儿！

上述选取原则具有一定普适性，希望大家记住，感兴趣的可以深入理解一下为什么遵循这些原则。

参考文献：

1.Burgess S, Thompson SG.Interpreting findings from Mendelian randomization using the MR-Egger method.Eur J Epidemiol. 2017 May;32(5):377-389. doi: 10.1007/s10654-017-0255-x. Epub2017 May 19.