在前几期的内容中,小陈带大家下载并处理好了数据,接下来就是用PLINK软件进行分析了,在分析之前,小陈先教大家如何下载并在Windows系统里使用PLINK软件。
在进行GWAS研究时,PLINK是我们最常使用的老牌软件(http://www.cog-genomics.org/plink/1.9/),其下载与使用也是非常简单的。
首先我们打开页面,确定好咱们Windows的操作系统(一般都是64位的,红色标记处),点击“download”后开始下载,如下图所示:

接下来将下载好的文件解压缩到plink文件夹,如下图所示:

点击进入plink文件夹后,里面会有如下5个文件,其中plink是可执行程序,但双击它没用,如下图所示:

此时我们需要在搜索框输入“CMD”进入命令提示符界面,如下图所示:

输入cd Downloads/plink 这个指令进入plink文件夹:

输入plink.exe --help指令后出现帮助文档,说明安装成功!具体如下图所示:

看完上述操作流程,希望帮助大家掌握如何在Windows里使用类似PLINK之类的命令行软件,咱们下期再见!